267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2186 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2186  luciferase-like protein  100 
 
 
310 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.423156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0594  luciferase-like protein  51.61 
 
 
312 aa  275  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3094  Luciferase-like monooxygenase  42.58 
 
 
311 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0527928  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  30.93 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.17 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  29.18 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  25.56 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  29.45 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  28.62 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6991  luciferase family protein  27.66 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  32.83 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  28.24 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  28.24 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  28.24 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  30.86 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  23.81 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  26.55 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.24 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.56 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  26.56 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.64 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  26 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  28.97 
 
 
336 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  23.79 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.9 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  27.4 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  26.6 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  27.4 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  27.4 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  27.03 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 
313 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  28.43 
 
 
285 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  24.58 
 
 
288 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  28.05 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  26.54 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  30.32 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  26.94 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  28.19 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  27.68 
 
 
285 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.42 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  22.85 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  25.55 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.57 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.06 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  32.33 
 
 
362 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  22.19 
 
 
365 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  25.4 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  22.78 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  27.27 
 
 
293 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 
278 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  28.19 
 
 
287 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.31 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  25.35 
 
 
405 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  28.02 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.63 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  28.48 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  26.6 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  29.59 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  30.46 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  25.29 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  26.67 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  21.38 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  26.28 
 
 
362 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  25.6 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  39.29 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  25.88 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  26.05 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  26.25 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  27.36 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  25.35 
 
 
290 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  24.26 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5777  luciferase family protein  27.18 
 
 
326 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  30.72 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  24.41 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  24.15 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  24.15 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  27.51 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  24.15 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  28.23 
 
 
380 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  29.08 
 
 
283 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  28.33 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  29.08 
 
 
283 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.03 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  27.32 
 
 
283 aa  52.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.17 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  30.39 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  26.77 
 
 
357 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.48 
 
 
285 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  27.56 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  24.49 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.27 
 
 
335 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
308 aa  52.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0810  luciferase family protein  28.04 
 
 
308 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2020  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.46 
 
 
248 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000114959  hitchhiker  0.00731044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  28.06 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  29.06 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.31 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>