168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2416 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2416  protein of unknown function DUF188  100 
 
 
149 aa  313  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.515927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3021  hypothetical protein  50.69 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0336  hypothetical protein  36.91 
 
 
149 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.455828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1794  protein of unknown function DUF188  35.44 
 
 
171 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.617904 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2782  hypothetical protein  37.76 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3095  hypothetical protein  37.06 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2823  hypothetical protein  37.32 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00370499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2849  hypothetical protein  36.36 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3063  hypothetical protein  36.36 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3075  hypothetical protein  36.36 
 
 
146 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3092  hypothetical protein  35.42 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000782368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2187  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0104605 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3061  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2842  hypothetical protein  34.97 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1505  hypothetical protein  36.17 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0131568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  32.89 
 
 
155 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0705  hypothetical protein  34.01 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0721  hypothetical protein  34.01 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2994  protein of unknown function DUF188  35.11 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0351846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  34.69 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  34.01 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  33.79 
 
 
161 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  32.65 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  33.79 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  36.11 
 
 
153 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1836  protein of unknown function DUF188  32.17 
 
 
147 aa  87  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000115415  normal  0.598347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2548  hypothetical protein  31.94 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2251  hypothetical protein  31.94 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  32.19 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  31.72 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  34.21 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  32.41 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  30.94 
 
 
150 aa  84.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  34.25 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  32.86 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1370  hypothetical protein  33.79 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.147353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  31.72 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  31.72 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  31.72 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  31.03 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  32.41 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  31.33 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  32.12 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  31.72 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  31.72 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  30.34 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3215  protein of unknown function DUF188  34.69 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  31.43 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  31.76 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  33.8 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  31.03 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  31.03 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  30.28 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1789  protein of unknown function DUF188  31.79 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00196575  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  30.41 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  30.56 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2206  hypothetical protein  30.87 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  31.03 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  30.14 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  30.34 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  30.43 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  31.88 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  38.19 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3042  hypothetical protein  30.61 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  33.1 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  29.93 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  28.08 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  28.77 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  31.97 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  30.34 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1275  hypothetical protein  33.1 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.594788  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  28.17 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  29.73 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  29.66 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  30.82 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  31.76 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1138  hypothetical protein  30.26 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  29.86 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  32.45 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  29.37 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  28.67 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  32.43 
 
 
188 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  29.86 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  29.45 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2151  hypothetical protein  27.7 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  26.39 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  29.66 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  28.86 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  29.66 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  28.97 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  29.86 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  28.47 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>