168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2254 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  330  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  92.68 
 
 		 164 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  89.26 
 
 		 155 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  84.25 
 
 		 158 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  82.88 
 
 		 166 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  82.31 
 
 		 176 aa  248  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  82.61 
 
 		 157 aa  240  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  64.67 
 
 		 155 aa  204  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  65.52 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  64.83 
 
 		 159 aa  201  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  63.46 
 
 		 157 aa  197  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  65.77 
 
 		 166 aa  194  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  63.33 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  60.53 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  60 
 
 		 188 aa  184  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  58.82 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  58.67 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  58.17 
 
 		 161 aa  181  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  57.24 
 
 		 162 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  60.27 
 
 		 154 aa  168  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  57.14 
 
 		 154 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  54.73 
 
 		 152 aa  168  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  55.33 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  51.68 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  52.7 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  53.1 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  60.53 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  50.98 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  55.63 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  53.9 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  53.79 
 
 		 146 aa  151  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  49.32 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  53.52 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  51.05 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  52.41 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  52.41 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  44.08 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  45.33 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  46.75 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  45.33 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  42.57 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  44.22 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  46.85 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  46.85 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  43.15 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  43.15 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  42.47 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  43.15 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  45.33 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  42.28 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  42.67 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  43.15 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  45.58 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  44.59 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  42.57 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  52.41 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  42.67 
 
 		 151 aa  127  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  44.3 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  46.15 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2168  hypothetical protein  48.97 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.455167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  41.77 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  40.13 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  41.77 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  40.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  43.62 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  43.62 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  43.62 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  43.62 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  42 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  40.94 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  38.62 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  40.27 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  39.74 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5044  hypothetical protein  44.3 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0664156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  41.61 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  39.31 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  41.5 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  39.19 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  40.41 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>