168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2152 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  316  9e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  91.67 
 
 
166 aa  289  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  79.47 
 
 
155 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  84.06 
 
 
164 aa  243  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  82.39 
 
 
176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  81.29 
 
 
158 aa  240  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  82.61 
 
 
164 aa  240  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  63.95 
 
 
159 aa  201  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  63.27 
 
 
159 aa  201  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  64.86 
 
 
157 aa  197  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  62.59 
 
 
155 aa  197  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  65.54 
 
 
166 aa  196  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  62.76 
 
 
159 aa  190  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  62.42 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  61.04 
 
 
154 aa  180  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  59.06 
 
 
188 aa  177  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  59.48 
 
 
154 aa  177  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  59.73 
 
 
161 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  59.06 
 
 
161 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  55.1 
 
 
168 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  55.17 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  53.1 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  52.67 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  53.38 
 
 
150 aa  160  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  54.48 
 
 
150 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  63.51 
 
 
166 aa  157  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  54.48 
 
 
146 aa  157  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  54.17 
 
 
154 aa  157  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  51.35 
 
 
165 aa  154  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  50.33 
 
 
150 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  50.69 
 
 
155 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  48.68 
 
 
154 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  51.63 
 
 
162 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  51.63 
 
 
162 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  52.45 
 
 
150 aa  146  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  53.06 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  45.21 
 
 
165 aa  133  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  53.85 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  41.45 
 
 
152 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  45.89 
 
 
155 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  42.67 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  42 
 
 
150 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  42 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  42 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  42.67 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  44.68 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2168  hypothetical protein  48.63 
 
 
156 aa  123  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.455167  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  44.59 
 
 
165 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  41.61 
 
 
155 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  42.95 
 
 
154 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  38.41 
 
 
151 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  44.52 
 
 
151 aa  120  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  43.06 
 
 
149 aa  120  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  40.67 
 
 
152 aa  120  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  40.94 
 
 
149 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  42 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  40.41 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  43.15 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  41.1 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  39.6 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  41.5 
 
 
150 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  40.27 
 
 
150 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  40.94 
 
 
159 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  42.28 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  38.51 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  38.51 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  41.61 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  38.51 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  40.28 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  40.67 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  40.27 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  40.94 
 
 
162 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  41.78 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  40 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  38.89 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  42.18 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  40.41 
 
 
151 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  41.1 
 
 
154 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  40.28 
 
 
150 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  38.96 
 
 
160 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  42.47 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  42.47 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  38.93 
 
 
160 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  38.26 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  41.22 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  41.43 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  41.43 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  41.43 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  41.43 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>