167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0652 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  76.13 
 
 		 159 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  75.48 
 
 		 159 aa  241  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  76.87 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  69.03 
 
 		 159 aa  215  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  68.49 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  66.23 
 
 		 161 aa  200  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  65.33 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  65.58 
 
 		 161 aa  198  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  68.24 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  65.52 
 
 		 164 aa  193  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  63.4 
 
 		 161 aa  193  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  64.83 
 
 		 164 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  64.29 
 
 		 157 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  61.9 
 
 		 176 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  64.96 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  67.11 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  57.14 
 
 		 154 aa  175  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  55.78 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  58.82 
 
 		 188 aa  170  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  56.55 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  57.33 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  60.4 
 
 		 154 aa  167  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  56.85 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  56.46 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  51.41 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  53.1 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  55.1 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  56.76 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  54.48 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  56.76 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  48.98 
 
 		 168 aa  150  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  52.38 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  54.55 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  52.45 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  51.7 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  55.32 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  46.94 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  43.05 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  43.54 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  46.58 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  45.58 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  41.38 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  43.62 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  39.07 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  45.71 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  44.67 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2168  hypothetical protein  47.26 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.455167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  39.86 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  42.11 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  39.19 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  40.4 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  42.95 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  40.54 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  39.19 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  42.57 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  43.92 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  40.82 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  41.78 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  38.19 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  42.18 
 
 		 160 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  42.28 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  36.99 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  43.84 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  41.5 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  37.75 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  40.28 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  39.46 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  36.3 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  38.93 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  42.57 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  36.3 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  40.97 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5044  hypothetical protein  41.38 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0664156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  38.41 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  40.27 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  36.67 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  35.57 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  37.67 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  37.58 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  36.91 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  33.77 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  36.24 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5282  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  37.67 
 
 		 147 aa  104  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  36.91 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  39.04 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  36.24 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>