167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1023 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  84.14 
 
 		 155 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  83.45 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  82.76 
 
 		 154 aa  246  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  61.97 
 
 		 150 aa  182  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  55.17 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  53.79 
 
 		 166 aa  156  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  56.93 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  53.79 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  54.48 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  55.8 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  49.32 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  53.1 
 
 		 159 aa  151  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  53.79 
 
 		 155 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  57.66 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  54.48 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  55.94 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  55.47 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  54.01 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  52 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  49.65 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  46.9 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  49.66 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  51.03 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  52.05 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  47.26 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  47.26 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  51.02 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  49.66 
 
 		 188 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  49.66 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  47.1 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  46.43 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  43.84 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  40.69 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  48.63 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  40.69 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  43.92 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  41.22 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  40.14 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  52.74 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  40.85 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  39.31 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  42.76 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  106  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  43.45 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  38.78 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  36.99 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  37.67 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  38.62 
 
 		 155 aa  103  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  40.27 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  35.62 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  43.97 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  38.78 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  40.82 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  37.59 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  40.14 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  41.13 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  41.13 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  37.84 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  40.14 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  41.1 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  36.73 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  40.67 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  38.89 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  36.05 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  36.55 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  36.55 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  37.41 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  40.85 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  38.36 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  37.84 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  36.73 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  36.55 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  36.55 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  43.06 
 
 		 150 aa  97.1  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  38.1 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  36.55 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  38.19 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  38 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  37.84 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  38 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  40.43 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>