169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2508 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  316  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  84.77 
 
 		 154 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  84.67 
 
 		 155 aa  266  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  82.76 
 
 		 146 aa  246  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  61.54 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  61.31 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  61.31 
 
 		 152 aa  166  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  57.64 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  59.12 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  57.66 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  54.86 
 
 		 166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  56.25 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  56.93 
 
 		 176 aa  157  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  55.56 
 
 		 159 aa  156  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  55.56 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  51.72 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  55.1 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  55.07 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  54.25 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  52.74 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  54.48 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  51.35 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  51.33 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  51.45 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  51.03 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  51.03 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  53.47 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  50.65 
 
 		 188 aa  141  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  47.52 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  50 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  49.64 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  48.28 
 
 		 162 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  48.28 
 
 		 162 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  47.14 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  45.83 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  44.44 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  49.32 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  46.9 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  49.33 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  44.83 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  43.75 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2206  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  43.97 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  44.68 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  40.28 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  39.31 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  38.19 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  39.04 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  38.78 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  42.96 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  42.96 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  39.31 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  41.61 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  37.67 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  40.28 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  40.28 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  51.02 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  37.93 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  42.21 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  39.01 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  43.26 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  37.24 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  37.24 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  37.93 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  37.24 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  42.28 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  41.61 
 
 		 160 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  36.3 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  39.46 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  40.97 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  37.24 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  38.73 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  39.58 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  39.73 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  39.73 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  38.26 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  36.88 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  38.19 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  34.93 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  40.85 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  40.85 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0274  hypothetical protein  35.37 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0301  hypothetical protein  35.37 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  40.85 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  40.85 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  40.85 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5044  hypothetical protein  38.89 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0664156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  39.46 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5282  hypothetical protein  39.58 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  39.73 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3212  protein of unknown function DUF188  40.41 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  36.99 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  38.78 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2168  hypothetical protein  42.18 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.455167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>