165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3557 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  74.66 
 
 		 147 aa  229  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  71.81 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  71.14 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  69.13 
 
 		 150 aa  225  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  72.22 
 
 		 152 aa  222  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  71.53 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  71.53 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  71.53 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  66.44 
 
 		 151 aa  221  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  67.11 
 
 		 150 aa  221  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  71.14 
 
 		 151 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  67.57 
 
 		 150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  65.77 
 
 		 151 aa  217  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  70.42 
 
 		 150 aa  216  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  65.77 
 
 		 151 aa  216  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  69.13 
 
 		 151 aa  216  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  65.1 
 
 		 151 aa  213  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  67.12 
 
 		 150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  67.12 
 
 		 150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  69.93 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  69.93 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  69.93 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3212  protein of unknown function DUF188  71.13 
 
 		 149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  69.93 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  67.12 
 
 		 150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  67.81 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  69.93 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  69.93 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  69.93 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  67.12 
 
 		 150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  65.75 
 
 		 148 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  66.44 
 
 		 150 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  69.23 
 
 		 154 aa  210  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  65.54 
 
 		 152 aa  210  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  67.12 
 
 		 149 aa  209  9e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  69.23 
 
 		 152 aa  209  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  66.44 
 
 		 150 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  70.83 
 
 		 148 aa  208  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  67.12 
 
 		 151 aa  208  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  67.79 
 
 		 151 aa  207  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  68.75 
 
 		 152 aa  207  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  65.07 
 
 		 151 aa  206  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  67.13 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  67.13 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  67.13 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  67.13 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  67.13 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  65.77 
 
 		 149 aa  203  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  63.7 
 
 		 165 aa  203  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  65.75 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  63.01 
 
 		 155 aa  197  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03247  hypothetical protein  63.7 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  65.52 
 
 		 150 aa  197  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  65.52 
 
 		 150 aa  197  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  61.64 
 
 		 147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  62.59 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  62.42 
 
 		 152 aa  191  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  61.74 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  61.74 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  61.74 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  60.27 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  60.96 
 
 		 155 aa  184  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  59.59 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  59.59 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  60.96 
 
 		 150 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  60.96 
 
 		 150 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  60.96 
 
 		 150 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  58.9 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  58.22 
 
 		 165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  58.33 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  56.85 
 
 		 148 aa  176  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  56.16 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  55.41 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  54.36 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  55.78 
 
 		 155 aa  166  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  53.74 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  52.38 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  50.68 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  52.38 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1138  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  51.7 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  48.99 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  47.95 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2206  hypothetical protein  45.27 
 
 		 165 aa  140  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  43.84 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0274  hypothetical protein  43.15 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  47.62 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0301  hypothetical protein  43.15 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  45.64 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  46.31 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  45.64 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1852  protein of unknown function DUF188  43.15 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  43.62 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  43.62 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  42.95 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5044  hypothetical protein  44.97 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0664156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  43.57 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  42.28 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01008  hypothetical protein  53.64 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>