168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4679 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  99.37 
 
 		 159 aa  319  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  90.97 
 
 		 155 aa  288  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  75.48 
 
 		 157 aa  241  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  72.37 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  64.19 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  64.29 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  68.75 
 
 		 164 aa  200  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  64.63 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  69.34 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  67.88 
 
 		 164 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  65.71 
 
 		 157 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  64.43 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  61.33 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  62.42 
 
 		 161 aa  191  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  61.74 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  55.92 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  66.22 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  59.73 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  56.46 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  62.16 
 
 		 154 aa  170  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  54.25 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  56.55 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  52.82 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  54.05 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  58.62 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  56.25 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  55.56 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  54.86 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  53.79 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  46.79 
 
 		 168 aa  150  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  53.1 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  49.66 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  53.15 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  50.35 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  48.97 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  47.65 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  45.39 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  46.26 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  42.18 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  45.39 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  46.67 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  51.05 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  41.22 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  42.58 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  45.58 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  45.33 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  45.14 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  45.14 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  41.38 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  39.35 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  40.41 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  43.15 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  41.38 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  45.21 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  45.27 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  42.18 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  40.69 
 
 		 150 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  41.38 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  40.69 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  43.54 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  40.97 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  40.69 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  44 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  40.14 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  44.29 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2168  hypothetical protein  46.79 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.455167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  42.38 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  39.6 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  43.05 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  43.15 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  41.78 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  37.75 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  39.04 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  36.84 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  36.84 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  36.84 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  39.46 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  40.41 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  40.41 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  40.82 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  40.82 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  38.93 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  38.93 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>