169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3070 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  56.46 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  57.93 
 
 
155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  56.55 
 
 
157 aa  168  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  58.62 
 
 
166 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  57.24 
 
 
159 aa  167  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  57.43 
 
 
152 aa  166  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  56.55 
 
 
159 aa  166  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  57.45 
 
 
158 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  55.41 
 
 
154 aa  163  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  56.83 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  56.83 
 
 
164 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  54.48 
 
 
166 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  50.68 
 
 
168 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  56.2 
 
 
157 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  55.86 
 
 
159 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  48.63 
 
 
165 aa  155  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  53.57 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  54.73 
 
 
188 aa  153  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  55.1 
 
 
154 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  150  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  150  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  50.68 
 
 
150 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  49.32 
 
 
161 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  51.45 
 
 
154 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  50.66 
 
 
162 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  48.97 
 
 
154 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  48.99 
 
 
150 aa  139  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  50.66 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  48.97 
 
 
155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  49.32 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  50.34 
 
 
150 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  46 
 
 
151 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  45.99 
 
 
150 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  46.21 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  48.68 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  47.1 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  54.79 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  45.32 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  44.44 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  42.36 
 
 
155 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  42.36 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  41.67 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  42.67 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  42.36 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  39.46 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  40.14 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  40.97 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  39.73 
 
 
151 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  40.97 
 
 
150 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  42 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  41.5 
 
 
149 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  40.97 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  39.33 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  41.01 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  39.04 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  39.73 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  39.33 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  40.28 
 
 
150 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  39.46 
 
 
151 aa  107  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  39.58 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  44.52 
 
 
165 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  41.55 
 
 
150 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  39.86 
 
 
151 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  40.67 
 
 
154 aa  105  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  38.78 
 
 
151 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  42.45 
 
 
150 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  42.45 
 
 
150 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  39.46 
 
 
149 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  38.78 
 
 
151 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  40.28 
 
 
150 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  39.58 
 
 
147 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  39.57 
 
 
149 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  39.19 
 
 
150 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  104  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  43.88 
 
 
154 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  38.67 
 
 
152 aa  104  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  38.1 
 
 
150 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  38.85 
 
 
165 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03247  hypothetical protein  40.28 
 
 
147 aa  104  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  38.78 
 
 
150 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  35.42 
 
 
153 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  39.46 
 
 
150 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  37.58 
 
 
151 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  38.78 
 
 
160 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  38.89 
 
 
162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  41.73 
 
 
147 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  38.89 
 
 
162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  40.28 
 
 
151 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  42.96 
 
 
150 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  42.96 
 
 
150 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  42.96 
 
 
150 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  40.14 
 
 
159 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  35.37 
 
 
150 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  40.97 
 
 
151 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2168  hypothetical protein  41.96 
 
 
156 aa  100  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.455167  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  38.19 
 
 
149 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  39.46 
 
 
151 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>