168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2806 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  75.16 
 
 		 154 aa  227  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  68.57 
 
 		 158 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  63.09 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  58.6 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  59.01 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  62.68 
 
 		 164 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  58.06 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  60.4 
 
 		 159 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  59.73 
 
 		 159 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  58.33 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  59.86 
 
 		 157 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  58.82 
 
 		 157 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2168  hypothetical protein  62.33 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.455167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  60 
 
 		 161 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  60 
 
 		 161 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  59.33 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  60 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  54.72 
 
 		 162 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  56 
 
 		 159 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  54.73 
 
 		 151 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  51.28 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  55.33 
 
 		 152 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  51.01 
 
 		 154 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  49.66 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  58.67 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  50.65 
 
 		 154 aa  141  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  52.03 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  50.33 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  52 
 
 		 150 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  51.35 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  52.05 
 
 		 150 aa  131  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  49.67 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  49.67 
 
 		 151 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  52.11 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  49.66 
 
 		 146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  48.3 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  49.3 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  43.71 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  45.7 
 
 		 151 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  42.57 
 
 		 150 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  42.57 
 
 		 155 aa  121  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  43.71 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  42.57 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  43.24 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  41.89 
 
 		 150 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  43.05 
 
 		 150 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  44.3 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  52.82 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  41.61 
 
 		 151 aa  118  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  40.62 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  43.42 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  46.62 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  46.62 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  46.62 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  43.71 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  41.89 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  45.95 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  45.95 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  41.72 
 
 		 154 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  41.72 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  41.22 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  42.38 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  43.05 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  45.95 
 
 		 150 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  41.72 
 
 		 154 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  45.45 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  45.45 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  41.89 
 
 		 151 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  41.61 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  43.92 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  43.92 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  44.03 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  41.06 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  40.54 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  38.16 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  38.16 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  44.22 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  37.84 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  38.51 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  40.27 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2206  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  39.6 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  42 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  39.19 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  42.36 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  41.22 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  38.41 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>