168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0086 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  302  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  59.86 
 
 		 152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  58.11 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  57.33 
 
 		 157 aa  168  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  54.05 
 
 		 159 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  53.38 
 
 		 159 aa  163  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  54.05 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  56.83 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  53.42 
 
 		 155 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  53.38 
 
 		 166 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  52.7 
 
 		 159 aa  159  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  53.06 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  53.74 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  53.69 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  53.06 
 
 		 161 aa  156  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  55.24 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  54.35 
 
 		 164 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  53.9 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  52.17 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  53.42 
 
 		 168 aa  151  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  50.68 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  148  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  51.72 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  50.67 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  48.63 
 
 		 165 aa  146  8e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  51.03 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  51.03 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  51.35 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  50.34 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  52 
 
 		 188 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  49.32 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  51.68 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  47.62 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  45.33 
 
 		 154 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  43.79 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  44.9 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  45.83 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  42.67 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  40.13 
 
 		 173 aa  116  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  42.38 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  48.61 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  42.28 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  39.44 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  38.89 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  39.33 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  41.33 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  38.93 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  40.82 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  37.84 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  41.72 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  41.72 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  41.33 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  39.04 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  39.46 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  41.33 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  40 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  36.24 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  37.93 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  37.93 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  36.24 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  36.24 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  41.33 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  38.73 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  38.89 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  38.89 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  39.58 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  38.19 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  37.93 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  38.19 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  38.19 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  38.89 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  37.93 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1646  protein of unknown function DUF188  39.31 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  36 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  38.62 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  39.31 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  38.62 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  35.33 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  41.55 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  37.33 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  36.62 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  36.55 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  35.57 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  38.41 
 
 		 162 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  38.82 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  37.93 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  38.67 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>