168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1877 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  315  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  96.08 
 
 
155 aa  303  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  84.77 
 
 
154 aa  269  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  83.45 
 
 
146 aa  255  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  62.24 
 
 
150 aa  184  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  58.39 
 
 
152 aa  164  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  54.86 
 
 
155 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  56.94 
 
 
155 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  55.56 
 
 
159 aa  153  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  54.86 
 
 
159 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  56.2 
 
 
164 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  51.72 
 
 
168 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  56.76 
 
 
157 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  56.2 
 
 
158 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  54.74 
 
 
164 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  51.39 
 
 
166 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  51.72 
 
 
150 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  55.63 
 
 
159 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  52.05 
 
 
150 aa  146  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  50.72 
 
 
157 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  49.32 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  51.66 
 
 
162 aa  143  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  51.82 
 
 
176 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  48.97 
 
 
151 aa  140  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  52.41 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  51.72 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  51.72 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  44.67 
 
 
154 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  50 
 
 
150 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  52.03 
 
 
188 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  45.75 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  45.75 
 
 
162 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  51.39 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  46.94 
 
 
151 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  49.32 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  48.68 
 
 
161 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  43.06 
 
 
155 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  44.83 
 
 
165 aa  122  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  45.52 
 
 
151 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  42.36 
 
 
152 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  43.06 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  43.06 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  38.26 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  42.95 
 
 
150 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  42.95 
 
 
150 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  51.02 
 
 
166 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  40.28 
 
 
149 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  38.19 
 
 
165 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  38.19 
 
 
162 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  38.19 
 
 
162 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  38.62 
 
 
149 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  41.78 
 
 
150 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  41.84 
 
 
154 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  38.1 
 
 
150 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  38.89 
 
 
155 aa  102  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  36.99 
 
 
151 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  41.22 
 
 
151 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  41.13 
 
 
154 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  38.19 
 
 
150 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  39.58 
 
 
150 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2206  hypothetical protein  36.05 
 
 
165 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  37.67 
 
 
152 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  40.27 
 
 
160 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  34.93 
 
 
148 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  34.93 
 
 
148 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  38.73 
 
 
147 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  39.6 
 
 
160 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  38.89 
 
 
148 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  38.78 
 
 
151 aa  100  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  36.81 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  36.81 
 
 
155 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  37.67 
 
 
152 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  36.17 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  36.11 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  39.72 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  38.73 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  36.73 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  37.93 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  37.93 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5044  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0664156  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  39.73 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  35.81 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  38.73 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3212  protein of unknown function DUF188  38.36 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5282  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  38.36 
 
 
151 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  39.44 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  39.44 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  39.44 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  34.01 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  34.01 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  39.44 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>