169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1457 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  100 
 
 		 154 aa  306  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  62.32 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  59.44 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  59.15 
 
 		 176 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  60.14 
 
 		 164 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  58.16 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  59.72 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  57.14 
 
 		 157 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  60.43 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  56.46 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  57.89 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  55.78 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  54.36 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  54.42 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  57.04 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  55.41 
 
 		 151 aa  163  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  51.68 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  52.03 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  50.33 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  49.67 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  51.01 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  50.67 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  52.74 
 
 		 154 aa  146  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  51.01 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  46.62 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  51.01 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  51.03 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  46.72 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  45.33 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  49.66 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  49.64 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  51.77 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  44.67 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  53.02 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  46.9 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  47.02 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  45.7 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  41.89 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  44.83 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  42.76 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  44.14 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  44.14 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  44.14 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  42.76 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  44.81 
 
 		 173 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  50.97 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  44.06 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  44.29 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  44.68 
 
 		 150 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  44.68 
 
 		 150 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  42.07 
 
 		 150 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  42.76 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  46.1 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  44.68 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  43.84 
 
 		 155 aa  123  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  42.57 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  39.6 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  41.5 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  41.84 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  44.68 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  43.33 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  39.72 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  39.04 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  40.82 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  40.94 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  39.04 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  41.61 
 
 		 162 aa  113  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  39.73 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  40.41 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  43.26 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  39.73 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  37.75 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  39.6 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  41.78 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  37.75 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  37.75 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  36.91 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  36.99 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  37.58 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  35.57 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  36.67 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  38.26 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  38.26 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  38.82 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  41.55 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  38.41 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  34.93 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  35.57 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  38.67 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  40.85 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>