163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5221 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  323  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5282  hypothetical protein  97.33 
 
 		 150 aa  273  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5044  hypothetical protein  92.67 
 
 		 150 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0664156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  83.89 
 
 		 149 aa  258  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  80.54 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  77.42 
 
 		 159 aa  251  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  75.17 
 
 		 160 aa  233  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  75.17 
 
 		 160 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  45.95 
 
 		 151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  46.94 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  44.97 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  42.28 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  41.33 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  42.95 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  42.95 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  42.95 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  43.84 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  42.95 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  45.7 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  43.62 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  40.14 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  41.61 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  41.78 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  41.78 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  46.48 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  40.94 
 
 		 150 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  40.41 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  41.22 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  43.57 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  44.37 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  41.78 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  39.87 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  42.58 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  41.33 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  41.33 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2206  hypothetical protein  38.51 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  41.1 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0274  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0301  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  40.41 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  39.04 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  38.36 
 
 		 150 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  38.36 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  40.38 
 
 		 176 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1852  protein of unknown function DUF188  39.19 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  38.36 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  38.36 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  41.61 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  37.84 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  41.38 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  36.24 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  37.67 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  36.81 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  39.04 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  41.78 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  41.61 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  38.36 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  39.04 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  38.93 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  117  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  39.73 
 
 		 147 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1646  protein of unknown function DUF188  41.5 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  39.04 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03247  hypothetical protein  40.41 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  40.69 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  40.94 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  38.36 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  41.78 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  40.94 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  38.93 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  41.55 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  39.74 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  40.14 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  35.57 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3212  protein of unknown function DUF188  37.32 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  40.82 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  40.82 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  37.32 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  37.32 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  37.32 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  37.32 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  37.32 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  36.11 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  35.62 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>