166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0110 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  100 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  79.05 
 
 		 162 aa  239  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  79.05 
 
 		 162 aa  239  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  80.95 
 
 		 150 aa  235  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  76.87 
 
 		 161 aa  207  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  64.19 
 
 		 151 aa  190  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  57.24 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  58 
 
 		 166 aa  153  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  54.55 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  53.62 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  54.55 
 
 		 157 aa  143  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  53.52 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  53.85 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  53.15 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  52.17 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  49.32 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  52.17 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  53.24 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  52.11 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  53.85 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  51.77 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  50.34 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  54.61 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  49.32 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  48.23 
 
 		 176 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  47.95 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  52.11 
 
 		 188 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  49.66 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  48.99 
 
 		 161 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  45.58 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  48.34 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  47.68 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  43.33 
 
 		 165 aa  116  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2168  hypothetical protein  49.32 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.455167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  42.18 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  47.18 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  50 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  43.45 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  42.76 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  42.76 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  42.76 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  41.38 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  42.07 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  39.01 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  41.26 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  43.45 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  41.55 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  37.67 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  42.76 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2206  hypothetical protein  34.9 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  41.06 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  39.16 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  38.51 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  37.76 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  37.76 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  37.93 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  41.96 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  41.96 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  41.96 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  40.27 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  37.76 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  37.24 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  37.06 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  37.75 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  41.38 
 
 		 161 aa  93.6  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  37.24 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  37.24 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  39.86 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  38.62 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  39.16 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  38.46 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  38.62 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  37.58 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  36.91 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  36.73 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3212  protein of unknown function DUF188  37.93 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  37.93 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  37.93 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  37.06 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>