167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3033 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  67.81 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  65.07 
 
 		 149 aa  206  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  66.44 
 
 		 151 aa  204  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  65.1 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  64.14 
 
 		 150 aa  204  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  61.74 
 
 		 151 aa  203  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  64.14 
 
 		 152 aa  203  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  65.75 
 
 		 150 aa  203  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  63.45 
 
 		 150 aa  201  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  61.74 
 
 		 150 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  62.91 
 
 		 151 aa  201  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  63.95 
 
 		 152 aa  201  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  63.95 
 
 		 152 aa  201  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  63.95 
 
 		 152 aa  201  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  63.7 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  60.4 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  61.74 
 
 		 149 aa  197  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  62.33 
 
 		 151 aa  197  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  62.59 
 
 		 152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  60.27 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  60.69 
 
 		 165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  61.07 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  62.07 
 
 		 151 aa  193  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  64.14 
 
 		 154 aa  193  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  60.69 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3212  protein of unknown function DUF188  63.89 
 
 		 149 aa  192  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  60.27 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  60 
 
 		 150 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  60.69 
 
 		 150 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  60 
 
 		 155 aa  191  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  59.31 
 
 		 150 aa  190  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  59.72 
 
 		 150 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  62.68 
 
 		 154 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  60 
 
 		 155 aa  187  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  61.97 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  61.97 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  61.97 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  61.97 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  61.97 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  61.97 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  61.97 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  61.97 
 
 		 152 aa  186  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  59.86 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  60.27 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  59.18 
 
 		 148 aa  183  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  59.31 
 
 		 148 aa  182  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  58.22 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  59.86 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  59.86 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  59.86 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  59.86 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  59.86 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  58.9 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  60.27 
 
 		 155 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  57.14 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  59.59 
 
 		 152 aa  177  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  57.14 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  60.96 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  59.06 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  55.7 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  57.72 
 
 		 150 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  57.05 
 
 		 150 aa  173  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  57.05 
 
 		 150 aa  173  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  57.72 
 
 		 150 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  54.36 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  52 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  56.25 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03247  hypothetical protein  55.48 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  57.53 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  57.53 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  57.53 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  51.33 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  54.11 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  51.72 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  50.34 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  48.63 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  47.33 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  50.33 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  49.01 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  51.75 
 
 		 161 aa  156  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1138  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  47.33 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  45.64 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  45.27 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0274  hypothetical protein  43.24 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0301  hypothetical protein  43.24 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2206  hypothetical protein  43.24 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  45.21 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  44.52 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  44.52 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01008  hypothetical protein  56.64 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1646  protein of unknown function DUF188  46 
 
 		 171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  40.94 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  41.78 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  41.78 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  41.43 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  41.43 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  41.1 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  40.85 
 
 		 157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>