167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03247 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03247  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  96.58 
 
 
149 aa  292  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  86.39 
 
 
149 aa  268  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  73.97 
 
 
151 aa  229  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  70.75 
 
 
147 aa  215  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  67.12 
 
 
151 aa  210  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  67.35 
 
 
151 aa  203  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  63.27 
 
 
147 aa  200  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  65.77 
 
 
152 aa  200  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  65.28 
 
 
150 aa  199  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  64.38 
 
 
150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  63.7 
 
 
149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  63.27 
 
 
151 aa  197  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  63.01 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  63.01 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  63.01 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  59.86 
 
 
151 aa  191  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  59.86 
 
 
148 aa  192  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  60.96 
 
 
151 aa  191  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  60.96 
 
 
150 aa  191  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3212  protein of unknown function DUF188  63.45 
 
 
149 aa  189  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  60.27 
 
 
150 aa  189  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  61.38 
 
 
150 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  58.9 
 
 
151 aa  184  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  62.5 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  59.18 
 
 
149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  58.11 
 
 
152 aa  180  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  58.33 
 
 
152 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  60.56 
 
 
152 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  60.56 
 
 
152 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  60.56 
 
 
152 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  60.56 
 
 
152 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  60.56 
 
 
152 aa  175  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  60.56 
 
 
152 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  60.56 
 
 
152 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  60.56 
 
 
152 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  59.86 
 
 
154 aa  174  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  56.16 
 
 
150 aa  174  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  59.15 
 
 
151 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  59.15 
 
 
151 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  59.15 
 
 
151 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  59.15 
 
 
151 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  59.15 
 
 
151 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  55.17 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  55.17 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  55.78 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  55.48 
 
 
151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  52.74 
 
 
150 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1138  hypothetical protein  54.17 
 
 
153 aa  166  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  54.11 
 
 
147 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  54.11 
 
 
147 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  54.48 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  54.48 
 
 
152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  53.79 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  53.1 
 
 
150 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  53.1 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  53.79 
 
 
151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  53.06 
 
 
165 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  52.41 
 
 
150 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  52.41 
 
 
162 aa  161  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  53.1 
 
 
155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  52.05 
 
 
161 aa  160  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  52.41 
 
 
150 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  51.03 
 
 
165 aa  156  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  155  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  51.37 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  52.05 
 
 
148 aa  150  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  50.68 
 
 
150 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  50.34 
 
 
155 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  50.68 
 
 
150 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  52.05 
 
 
148 aa  150  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  48.3 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  48.63 
 
 
154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  48.63 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  47.95 
 
 
152 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  45.21 
 
 
154 aa  140  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  46.58 
 
 
173 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2206  hypothetical protein  44.59 
 
 
165 aa  136  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  44.52 
 
 
155 aa  135  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  43.54 
 
 
153 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0274  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  45.89 
 
 
151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0301  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  42.18 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01008  hypothetical protein  57.27 
 
 
116 aa  126  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206325  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1852  protein of unknown function DUF188  41.1 
 
 
148 aa  120  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  39.73 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  40.41 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  39.73 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  40.41 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1646  protein of unknown function DUF188  40.82 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  36.99 
 
 
159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5044  hypothetical protein  39.73 
 
 
150 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0664156  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  36.99 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5282  hypothetical protein  39.73 
 
 
150 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  37.67 
 
 
160 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>