169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1019 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  304  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  62.24 
 
 
154 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  62.24 
 
 
155 aa  182  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  61.97 
 
 
146 aa  182  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  61.54 
 
 
154 aa  181  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  54.73 
 
 
152 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  54.79 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  56.85 
 
 
157 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  54.48 
 
 
155 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  58.62 
 
 
159 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  53.06 
 
 
150 aa  158  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  56.93 
 
 
164 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  57.93 
 
 
159 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  54.29 
 
 
176 aa  156  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  54.74 
 
 
158 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  53.38 
 
 
161 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  54.01 
 
 
164 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  56.55 
 
 
155 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  51.68 
 
 
161 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  51.68 
 
 
161 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  51.02 
 
 
166 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  54.74 
 
 
157 aa  151  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  50.34 
 
 
168 aa  148  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  54.48 
 
 
159 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  48.61 
 
 
150 aa  143  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  51.03 
 
 
154 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  49.32 
 
 
150 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  46.62 
 
 
150 aa  140  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  47.02 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  47.02 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  49.32 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  45.7 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  45.58 
 
 
165 aa  133  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  51.09 
 
 
162 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  46.62 
 
 
173 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  48.3 
 
 
188 aa  126  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  48.3 
 
 
161 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  42.57 
 
 
154 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  49.32 
 
 
166 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  43.92 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  41.5 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  42.18 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  41.5 
 
 
149 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  43.92 
 
 
150 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  43.92 
 
 
150 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  42.18 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  41.5 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  39.73 
 
 
151 aa  111  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  42.18 
 
 
154 aa  110  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  40.14 
 
 
151 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  39.19 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  40.97 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  39.87 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  40.14 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  40.41 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  42 
 
 
160 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  39.58 
 
 
162 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  40.28 
 
 
150 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  40.97 
 
 
150 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  40.97 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  40.28 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  40.97 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  40 
 
 
147 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  40 
 
 
147 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  41.13 
 
 
161 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  40.97 
 
 
150 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  41.33 
 
 
160 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  38.85 
 
 
159 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  40.28 
 
 
150 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  44.29 
 
 
152 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1646  protein of unknown function DUF188  41.22 
 
 
171 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  41.01 
 
 
150 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  39.46 
 
 
155 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  39.58 
 
 
151 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  41.67 
 
 
150 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  41.67 
 
 
150 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  41.67 
 
 
150 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  41.38 
 
 
165 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  39.07 
 
 
152 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  40.29 
 
 
147 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  42.96 
 
 
152 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  42.96 
 
 
152 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  42.25 
 
 
151 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  42.25 
 
 
151 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  40.97 
 
 
150 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  42.96 
 
 
152 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  40.97 
 
 
150 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  42.96 
 
 
152 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  39.58 
 
 
149 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  42.25 
 
 
151 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  42.96 
 
 
152 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  41.01 
 
 
151 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  42.96 
 
 
152 aa  100  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  42.96 
 
 
152 aa  100  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  42.96 
 
 
152 aa  100  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  42.25 
 
 
151 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  42.25 
 
 
151 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5044  hypothetical protein  38.51 
 
 
150 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0664156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>