169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3085 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  310  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  82.12 
 
 		 166 aa  256  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  90.07 
 
 		 164 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  87.94 
 
 		 164 aa  254  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  80.71 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  80.28 
 
 		 157 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  79.17 
 
 		 176 aa  236  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  66.23 
 
 		 155 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  64.29 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  63.64 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  68.49 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  66.44 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  64.29 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  62.84 
 
 		 161 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  61.22 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  60.54 
 
 		 161 aa  183  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  59.44 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  58.06 
 
 		 188 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  56.46 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  55.41 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  57.64 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  50.34 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  58.28 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  54.48 
 
 		 150 aa  160  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  53.42 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  52.38 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  51.03 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0222  protein of unknown function DUF188  63.01 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  54.86 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  54.86 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  53.79 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3446  hypothetical protein  51.75 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  51.63 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  51.63 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  53.52 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  48.94 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5130  hypothetical protein  46.05 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5221  hypothetical protein  45.7 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1915  hypothetical protein  46.62 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  41.33 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3122  hypothetical protein  51.66 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  40.67 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  41.33 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  38.82 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  40.67 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  40.67 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  44.97 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  45.77 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  44.76 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  44.76 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  39.33 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  44 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  42.28 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69280  hypothetical protein  43.33 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  41.06 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  40.82 
 
 		 165 aa  123  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  42.28 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  37.75 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2168  hypothetical protein  48.63 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.455167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  38.67 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  41.06 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  39.07 
 
 		 173 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  38.26 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  41.45 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  43.75 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5044  hypothetical protein  44.97 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0664156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5282  hypothetical protein  44.67 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  40.71 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  38.82 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  37.93 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  44.14 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  44.14 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  44.14 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  39.86 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  40.69 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  39.19 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  40.67 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  36.55 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>