154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1789 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1789  protein of unknown function DUF188  100 
 
 
150 aa  313  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00196575  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1505  hypothetical protein  61.97 
 
 
150 aa  189  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0131568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1370  hypothetical protein  58.16 
 
 
152 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.147353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1275  hypothetical protein  57.93 
 
 
150 aa  183  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.594788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3215  protein of unknown function DUF188  57.04 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2251  hypothetical protein  41.26 
 
 
149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2548  hypothetical protein  41.26 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2994  protein of unknown function DUF188  41.96 
 
 
153 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0351846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3042  hypothetical protein  42 
 
 
149 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08240  hypothetical protein  37.24 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3075  hypothetical protein  38.41 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2849  hypothetical protein  38.41 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3063  hypothetical protein  38.41 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2187  hypothetical protein  38.41 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0104605 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3061  hypothetical protein  38.41 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3092  hypothetical protein  37.68 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000782368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2842  hypothetical protein  38.41 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3095  hypothetical protein  37.68 
 
 
146 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2823  hypothetical protein  37.68 
 
 
146 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00370499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2782  hypothetical protein  37.68 
 
 
146 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1836  protein of unknown function DUF188  40.27 
 
 
147 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000115415  normal  0.598347 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0705  hypothetical protein  36.17 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0721  hypothetical protein  36.17 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2416  protein of unknown function DUF188  31.79 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.515927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  33.57 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3021  hypothetical protein  34.06 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0336  hypothetical protein  31.47 
 
 
149 aa  76.6  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.455828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  36.69 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  35.25 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  34.93 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  35.97 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  33.1 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  36.23 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  36.81 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1794  protein of unknown function DUF188  32.52 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.617904 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  36.81 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  35.25 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  33.81 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  32.87 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  33.81 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  33.09 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  33.09 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  30.71 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  33.09 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  33.33 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  32.62 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  33.56 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  34.29 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  34.25 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  31.51 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  32.67 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  33.33 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  28.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  32.61 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  25.9 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  34.04 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  33.57 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  32.62 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  32.62 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  32.62 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  32.61 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  30.82 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  31.65 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  31.88 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  32.37 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  32.62 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  30.94 
 
 
151 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  30.99 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  33.1 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  30.43 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  30.99 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  35 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  30.94 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  31.65 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  33.33 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  35 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  31.65 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  30.22 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  32.37 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  32.37 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  31.91 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  32.37 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  32.37 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  29.5 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  30.43 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  34.53 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  28.26 
 
 
166 aa  57  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  32.37 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0285861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>