156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0336 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0336  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  307  4e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.455828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0705  hypothetical protein  68.71 
 
 		 152 aa  221  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0721  hypothetical protein  68.71 
 
 		 152 aa  221  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3061  hypothetical protein  48.25 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3075  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3092  hypothetical protein  48.95 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000782368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2842  hypothetical protein  48.95 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2187  hypothetical protein  48.25 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0104605 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2782  hypothetical protein  50.69 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3095  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  150  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2823  hypothetical protein  48.25 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00370499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2849  hypothetical protein  49.31 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3063  hypothetical protein  49.31 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1836  protein of unknown function DUF188  36.55 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000115415  normal  0.598347 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2416  protein of unknown function DUF188  36.91 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.515927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1370  hypothetical protein  38.1 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.147353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3021  hypothetical protein  36.05 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1505  hypothetical protein  34.69 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0131568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3215  protein of unknown function DUF188  38.1 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3042  hypothetical protein  33.11 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2994  protein of unknown function DUF188  34.78 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0351846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08240  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1275  hypothetical protein  29.73 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.594788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2548  hypothetical protein  31.72 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2251  hypothetical protein  31.72 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1794  protein of unknown function DUF188  27.22 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.617904 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  31.88 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  30.61 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1789  protein of unknown function DUF188  31.47 
 
 		 150 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00196575  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  28.78 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  29.17 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  31.11 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  31.94 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  28.08 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  29.71 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  29.25 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  32.21 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5469  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0892827  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  30.82 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  30.82 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  29.86 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  30.34 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  36 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  28.38 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  32.19 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  29.05 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  30.14 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  29.45 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  29.05 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  29.14 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  27.89 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  31.29 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5991  hypothetical protein  29.25 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  29.86 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  27.4 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  31.88 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2376  hypothetical protein  30.5 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.465353  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  28.47 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0294  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0110  protein of unknown function DUF188  30.41 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  27.7 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  27.03 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  28.47 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  30.6 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  28.17 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0853  hypothetical protein  31.17 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  29.25 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  30.94 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  28.08 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  30.94 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  28.28 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  28.48 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  26.53 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  29.93 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2512  hypothetical protein  30.52 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  26.53 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47470  hypothetical protein  28.1 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03247  hypothetical protein  27.08 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  28.38 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0756  hypothetical protein  27.89 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  27.81 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  32.37 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  30.07 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>