162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2548 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2548  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2251  hypothetical protein  97.32 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3042  hypothetical protein  42.95 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2994  protein of unknown function DUF188  46.48 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0351846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1836  protein of unknown function DUF188  40.41 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000115415  normal  0.598347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1505  hypothetical protein  45.83 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0131568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1370  hypothetical protein  41.78 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.147353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1789  protein of unknown function DUF188  41.26 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00196575  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3215  protein of unknown function DUF188  43.61 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1275  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.594788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08240  hypothetical protein  37.16 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3092  hypothetical protein  33.82 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000782368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3095  hypothetical protein  33.09 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2823  hypothetical protein  33.09 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00370499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2849  hypothetical protein  32.35 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2782  hypothetical protein  33.09 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3063  hypothetical protein  32.35 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3075  hypothetical protein  32.35 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3061  hypothetical protein  32.35 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2187  hypothetical protein  32.35 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0104605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2842  hypothetical protein  31.62 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2416  protein of unknown function DUF188  31.94 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.515927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0336  hypothetical protein  31.72 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.455828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0705  hypothetical protein  31.08 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0721  hypothetical protein  31.08 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218627  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1794  protein of unknown function DUF188  34.84 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.617904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  31.34 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  29.33 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1466  hypothetical protein  27.21 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000321151  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  31.33 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  31.58 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  27.7 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  30.2 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  30.87 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  30.87 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1910  hypothetical protein  30.41 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000461668  normal  0.152713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  30.87 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1457  protein of unknown function DUF188  28.77 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0374008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  30.87 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  31.08 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  31.76 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  29.05 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  29.53 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  28.08 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  32.33 
 
 		 152 aa  67  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0754  hypothetical protein  30.2 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  29.05 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  30.67 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  30.41 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  26 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  30.2 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  28.38 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  26.53 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  29.45 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  25.34 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  26.9 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  25.34 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  25.34 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  26.9 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  24.66 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  27.03 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1392  hypothetical protein  27.33 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.980981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  25.34 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1279  hypothetical protein  27.33 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  29.45 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  25 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  28 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2785  hypothetical protein  27.33 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804529 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  29.84 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  29.05 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  30.34 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  28.86 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  26.03 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  26.71 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  28.67 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  27.4 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  27.7 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  24.32 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0992  hypothetical protein  27.33 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  24.32 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  25.34 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  28.38 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1023  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  27.33 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  27.82 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  28.89 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  24.83 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  24.34 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  22.6 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  25.35 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3291  protein of unknown function DUF188  28.19 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.363648  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  21.92 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0652  hypothetical protein  23.65 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.962889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  28.36 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>