163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1370 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1370  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.147353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1505  hypothetical protein  60 
 
 		 150 aa  198  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0131568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1789  protein of unknown function DUF188  58.16 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00196575  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3215  protein of unknown function DUF188  54.93 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1275  hypothetical protein  54.48 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.594788  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2251  hypothetical protein  41.78 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2548  hypothetical protein  41.78 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3042  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2994  protein of unknown function DUF188  38.26 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0351846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3095  hypothetical protein  37.67 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2823  hypothetical protein  37.67 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00370499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2849  hypothetical protein  36.99 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3063  hypothetical protein  36.99 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3075  hypothetical protein  36.99 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08240  hypothetical protein  37.24 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2782  hypothetical protein  36.99 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3092  hypothetical protein  37.67 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000782368  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0336  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.455828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3061  hypothetical protein  36.3 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2187  hypothetical protein  36.3 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0104605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2842  hypothetical protein  35.62 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1836  protein of unknown function DUF188  38.1 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000115415  normal  0.598347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3021  hypothetical protein  35.21 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0705  hypothetical protein  34.23 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0721  hypothetical protein  34.23 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218627  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1794  protein of unknown function DUF188  37.34 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.617904 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2416  protein of unknown function DUF188  33.79 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.515927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  35.71 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  31.94 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  31.51 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  32.21 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  33.11 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  30.56 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002736  hypothetical protein  32.45 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000350127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  30.87 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  31.54 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2584  protein of unknown function DUF188  31.51 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  30.2 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  30.87 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  30 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  29.14 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  31.69 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  31.69 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  29.93 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  31.69 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  31.69 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  31.69 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  31.76 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  32.19 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03247  hypothetical protein  31.51 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1995  hypothetical protein  28.19 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  30.72 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  28.76 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  29.25 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0405  hypothetical protein  30.82 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  29.25 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  32.88 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  32.61 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0103  hypothetical protein  32.19 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.688128  normal  0.0613985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  29.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  28.19 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  34.31 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  29.25 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  28.48 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  27.63 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  27.81 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2258  hypothetical protein  30.82 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3584  hypothetical protein  29.53 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2152  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  31.25 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  31.25 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2079  hypothetical protein  32.67 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  31.51 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  29.14 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  28.95 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  27.33 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  31.11 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  28.86 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  31.62 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  31.03 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  29.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  31.11 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  29.14 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0701  hypothetical protein  26.49 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.747154  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  30.82 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  32.59 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>