168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2994 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2994  protein of unknown function DUF188  100 
 
 		 153 aa  309  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0351846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3042  hypothetical protein  52.41 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1836  protein of unknown function DUF188  47.45 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000115415  normal  0.598347 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2251  hypothetical protein  47.18 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2548  hypothetical protein  46.48 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1505  hypothetical protein  44.37 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0131568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08240  hypothetical protein  45.39 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3215  protein of unknown function DUF188  43.75 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2849  hypothetical protein  42.34 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3063  hypothetical protein  42.34 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3095  hypothetical protein  42.34 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2823  hypothetical protein  42.34 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00370499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3075  hypothetical protein  41.61 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3092  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000782368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2782  hypothetical protein  41.61 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2842  hypothetical protein  39.71 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1370  hypothetical protein  38.26 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.147353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2187  hypothetical protein  40.15 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0104605 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3061  hypothetical protein  40.15 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1789  protein of unknown function DUF188  41.96 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00196575  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0705  hypothetical protein  38.57 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0721  hypothetical protein  38.57 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2416  protein of unknown function DUF188  35.11 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.515927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3021  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1275  hypothetical protein  33.81 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.594788  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0336  hypothetical protein  34.78 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.455828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  34.44 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2254  hypothetical protein  37.59 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708968  normal  0.0821386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1794  protein of unknown function DUF188  34.62 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.617904 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  36.17 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3085  hypothetical protein  37.32 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  32.64 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  34.78 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  30.94 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5144  protein of unknown function DUF188  32.61 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.0511941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  34.72 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  34.04 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  34.04 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  30 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  30.71 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  30.71 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  30.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1612  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3170  hypothetical protein  34.31 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  34.43 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  30.71 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  30.22 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3557  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  32.19 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  29.86 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  30.22 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  30.41 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  30.22 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  30.22 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  29.5 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  30.22 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  29.5 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1019  hypothetical protein  29.79 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  28.78 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  29.17 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1808  hypothetical protein  30.22 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2485  hypothetical protein  30.5 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2551  hypothetical protein  31.16 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  28.78 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  29.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3592  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515972  normal  0.0368306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2508  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  29.17 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0088  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3033  hypothetical protein  27.14 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0170362  hitchhiker  0.0000251302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1913  hypothetical protein  31.69 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1206  hypothetical protein  30.43 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>