146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1275 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  296  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.594788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3215  protein of unknown function DUF188  59.15 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1505  hypothetical protein  60.27 
 
 		 150 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0131568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1789  protein of unknown function DUF188  57.93 
 
 		 150 aa  183  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00196575  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1370  hypothetical protein  54.48 
 
 		 152 aa  170  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.147353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2251  hypothetical protein  37.84 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3042  hypothetical protein  36.24 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2548  hypothetical protein  37.16 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2994  protein of unknown function DUF188  33.81 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0351846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1836  protein of unknown function DUF188  32.67 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000115415  normal  0.598347 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0336  hypothetical protein  29.73 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.455828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08240  hypothetical protein  29.86 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3021  hypothetical protein  32.88 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0705  hypothetical protein  28.47 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0721  hypothetical protein  28.47 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2782  hypothetical protein  30.82 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2849  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3075  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3063  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3095  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2823  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00370499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2187  hypothetical protein  29.45 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0104605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2842  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3061  hypothetical protein  29.45 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2416  protein of unknown function DUF188  33.1 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.515927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3092  hypothetical protein  28.77 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000782368  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1794  protein of unknown function DUF188  34.16 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.617904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1725  hypothetical protein  34.01 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2865  protein of unknown function DUF188  33.57 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3267  YaiI/YqxD family protein  33.57 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0658  protein of unknown function DUF188  31.43 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.433189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1624  protein of unknown function DUF188  34.92 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.528791  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3544  hypothetical protein  30.56 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1444  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0449  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0059  protein of unknown function DUF188  31.76 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0858  hypothetical protein  32.35 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4014  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0247163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1350  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2894  YaiI/YqxD family protein  30.94 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1560  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1579  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.933051  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4809  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449328  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3465  hypothetical protein  30.41 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0171  YaiI/YqxD family protein  31.51 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5627  hypothetical protein  30.14 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0952  hypothetical protein  30.88 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.745509  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1096  hypothetical protein  30.88 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0086  hypothetical protein  28 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1180  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1660  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1097  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1627  hypothetical protein  29.08 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0463809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1634  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285861 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0052  hypothetical protein  29.37 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2006  protein of unknown function DUF188  31.25 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7278800000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2726  hypothetical protein  31.2 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1318  hypothetical protein  28.8 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3245  hypothetical protein  30.71 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.079374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0304  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5655  protein of unknown function DUF188  29.53 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.952909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1904  hypothetical protein  34.92 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2540  hypothetical protein  32.03 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00334  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3221  protein of unknown function DUF188  30.71 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0461  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0455  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0414  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00338  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0710  protein of unknown function DUF188  28.47 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0417  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1560  hypothetical protein  28.37 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0485  hypothetical protein  31.43 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1979  hypothetical protein  34.92 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0430  hypothetical protein  31.43 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0424  hypothetical protein  31.43 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  34.04 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0425  hypothetical protein  31.43 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0443  hypothetical protein  31.43 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.739826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5221  protein of unknown function DUF188  29.29 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2958  hypothetical protein  30.4 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2221  protein of unknown function DUF188  31.25 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000577909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1635  hypothetical protein  28.37 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51526  normal  0.0351466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1650  hypothetical protein  28.78 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1852  protein of unknown function DUF188  28.97 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1589  protein of unknown function DUF188  32 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2879  hypothetical protein  30.3 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.746438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2632  hypothetical protein  31.2 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0806571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3201  hypothetical protein  29.5 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1703  hypothetical protein  28 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.782315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2806  hypothetical protein  34.27 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.0624566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2514  protein of unknown function DUF188  28.78 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.773631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2276  hypothetical protein  28.08 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429783  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5138  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.817097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1771  hypothetical protein  28.06 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.338503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1764  hypothetical protein  28.06 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3212  protein of unknown function DUF188  29.79 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2186  hypothetical protein  26.9 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3070  hypothetical protein  32.88 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>