More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4641 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  224  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  48.51 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  48.11 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  41.82 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  42.72 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  43.52 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  51.35 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 488 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  41.38 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 480 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.29 
 
 		 480 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.29 
 
 		 480 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 480 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 480 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 480 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 480 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.29 
 
 		 483 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 480 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35 
 
 		 477 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  35 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  41.89 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 470 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  35 
 
 		 477 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  40.87 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.44 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  43.48 
 
 		 491 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  46.05 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.04 
 
 		 494 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.05 
 
 		 444 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 554 aa  54.7  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  37.65 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 500 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 480 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  36.78 
 
 		 321 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 507 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 507 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 321 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 507 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 226 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.79 
 
 		 503 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.86 
 
 		 491 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.68 
 
 		 495 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 520 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 501 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  39.36 
 
 		 498 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 304 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  32.56 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 502 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 502 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1267  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 502 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  39.02 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0087  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 525 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 469 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.46 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  29.09 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 475 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 496 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.27 
 
 		 467 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>