More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2636 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2636  integrase catalytic subunit  100 
 
 
373 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3778  integrase catalytic subunit  46.84 
 
 
386 aa  348  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2637  integrase catalytic subunit  39.5 
 
 
370 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0842  Integrase catalytic region  46.25 
 
 
252 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2546  Integrase catalytic region  41.35 
 
 
274 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4217  Integrase catalytic region  41.73 
 
 
274 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0771  Integrase catalytic region  41.73 
 
 
274 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  40 
 
 
281 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2557  Integrase catalytic region  40.67 
 
 
274 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  41.87 
 
 
291 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.16 
 
 
277 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.28 
 
 
286 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.28 
 
 
286 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.28 
 
 
286 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.28 
 
 
286 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.28 
 
 
286 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  39.33 
 
 
270 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  39.33 
 
 
270 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  39.7 
 
 
270 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  39.7 
 
 
270 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  39.7 
 
 
270 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  39.7 
 
 
270 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  39.7 
 
 
270 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
390 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
390 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
393 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
390 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  38.32 
 
 
280 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  38.32 
 
 
280 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  38.32 
 
 
280 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  36.49 
 
 
294 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  40.82 
 
 
278 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  37.5 
 
 
291 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  37.5 
 
 
291 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  35.82 
 
 
296 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  35.82 
 
 
296 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  35.82 
 
 
296 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  35.82 
 
 
296 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  36.17 
 
 
296 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  36.17 
 
 
296 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  36.49 
 
 
294 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  36.49 
 
 
294 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  36.49 
 
 
294 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  36.49 
 
 
294 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  36.99 
 
 
302 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  39.7 
 
 
275 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  39.7 
 
 
275 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  39.7 
 
 
275 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 
289 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  35.42 
 
 
296 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  38.38 
 
 
282 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  38.38 
 
 
282 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  38.38 
 
 
282 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  38.38 
 
 
282 aa  186  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  35.92 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  35.92 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  35.92 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  35.92 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  35.92 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  35.92 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  35.92 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
289 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  34.39 
 
 
297 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  36.16 
 
 
279 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  36.16 
 
 
279 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  38.01 
 
 
282 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  35.59 
 
 
286 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  35.59 
 
 
286 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  35.59 
 
 
286 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  35.93 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  38.43 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  33.45 
 
 
285 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  36.49 
 
 
286 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  34.88 
 
 
286 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  34.88 
 
 
286 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  35.23 
 
 
286 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  35.59 
 
 
286 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  34.15 
 
 
288 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  32.51 
 
 
379 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  35.23 
 
 
286 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  35.23 
 
 
286 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  35.23 
 
 
286 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>