More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3066 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  100 
 
 
365 aa  748    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02475  predicted methyltransferase  76.99 
 
 
345 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.973085  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  77.53 
 
 
345 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  76.99 
 
 
345 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0787829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  76.99 
 
 
345 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2955  putative methyltransferase  76.99 
 
 
345 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122463  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  77.53 
 
 
345 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  76.99 
 
 
345 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2734  putative methyltransferase  76.99 
 
 
345 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00198303  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  77.53 
 
 
345 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  77.53 
 
 
345 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1096  putative methyltransferase  76.99 
 
 
345 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00945167  normal  0.153252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  76.71 
 
 
345 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  77.26 
 
 
345 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  67.29 
 
 
366 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  62.08 
 
 
382 aa  464  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  61.6 
 
 
388 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  62.02 
 
 
383 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  63.76 
 
 
349 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  60.05 
 
 
388 aa  454  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  58.75 
 
 
395 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  58.5 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  41.98 
 
 
333 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0299  tRNA/rRNA methyltransferase  41.06 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.95 
 
 
278 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01826  tRNA/rRNA methyltransferase  40.85 
 
 
240 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1790  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.74 
 
 
250 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0549  RNA methyltransferase  33.71 
 
 
282 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106936  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  31.01 
 
 
288 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2713  RNA methyltransferase  31.38 
 
 
255 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.29 
 
 
248 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  29.55 
 
 
250 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.17 
 
 
234 aa  96.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  29.22 
 
 
252 aa  96.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.8 
 
 
246 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.97 
 
 
232 aa  95.1  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0619  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.29 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.91 
 
 
652 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.69 
 
 
246 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.42 
 
 
246 aa  93.2  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.29 
 
 
246 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1489  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.58 
 
 
244 aa  92  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.58 
 
 
246 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.25 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.08 
 
 
246 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.74 
 
 
251 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.15 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.22 
 
 
246 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.02 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0729  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.22 
 
 
246 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.63 
 
 
246 aa  90.1  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  29.05 
 
 
250 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.22 
 
 
246 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  26.86 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.22 
 
 
246 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  89.7  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.38 
 
 
310 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0696  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.67 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.54 
 
 
247 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2125  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.77 
 
 
267 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0139  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.34 
 
 
239 aa  89.4  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.69 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.55 
 
 
246 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  27.16 
 
 
251 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.51 
 
 
248 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0306  TrmH family tRNA methyltransferase  30.57 
 
 
268 aa  86.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  29.41 
 
 
248 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0533  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.81 
 
 
243 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  27.8 
 
 
248 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  30.58 
 
 
251 aa  85.9  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.88 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  29.92 
 
 
245 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1764  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.68 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.356011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.37 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  32.8 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.8 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  27.8 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  32.8 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  27.39 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  29.88 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.85 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  27.98 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  26.67 
 
 
257 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  26.67 
 
 
257 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.8 
 
 
247 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  28.57 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.16 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.57 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.4 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  30.33 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  26.97 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.77 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  27.23 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0683  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.96 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.427045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.89 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  29.63 
 
 
270 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  30 
 
 
245 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.6 
 
 
248 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.81 
 
 
243 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.95 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>