More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0299 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0299  tRNA/rRNA methyltransferase  100 
 
 		 364 aa  754    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  41.51 
 
 		 349 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  37.86 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  42.86 
 
 		 397 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  37.93 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  37.62 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02475  predicted methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.973085  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.63 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0787829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2734  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00198303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2955  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  41.63 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1096  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00945167  normal  0.153252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  37.62 
 
 		 388 aa  208  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  41.22 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  41.63 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  42.04 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  41.06 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  36.63 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.2 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01826  tRNA/rRNA methyltransferase  29.11 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2713  RNA methyltransferase  33.14 
 
 		 255 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1790  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.92 
 
 		 250 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0549  RNA methyltransferase  30.77 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106936  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  28.11 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.31 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  31.55 
 
 		 242 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.12 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.57 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.15 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  29.41 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  28.72 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.57 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.5 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.27 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.66 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0619  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.59 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0139  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.82 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0696  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.36 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  21.1 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.78 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0065  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.91 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000946676  normal  0.572135 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.73 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  29.73 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  29.73 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  24.86 
 
 		 536 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0060  RNA methyltransferase  26.51 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.024169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.73 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  26.7 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  29.73 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  25.1 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.9 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.35 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3859  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.57 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.35 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.75 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.14 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.35 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.35 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.27 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  29.73 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  29.73 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.28 
 
 		 652 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  28.88 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3553  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.97 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04047  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  27.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5696  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  24.69 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.45 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.81 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3833  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000869352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04009  hypothetical protein  27.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4651  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.326823 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.16 
 
 		 246 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4740  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.38 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1731  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.64 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  23.49 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  26.67 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  27.37 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.53 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  26.97 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.19 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0533  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  23.24 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  26.25 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.34 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  25.83 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  25.83 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.12 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  28.65 
 
 		 260 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  25.64 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  26.78 
 
 		 248 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>