More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2713 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2713  RNA methyltransferase  100 
 
 
255 aa  523  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1790  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.8 
 
 
250 aa  171  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0549  RNA methyltransferase  33.2 
 
 
282 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106936  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  33.61 
 
 
333 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01826  tRNA/rRNA methyltransferase  31.6 
 
 
240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.22 
 
 
278 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  32.64 
 
 
349 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  32.64 
 
 
388 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  32.23 
 
 
395 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  32.64 
 
 
388 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  33.05 
 
 
366 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  31.95 
 
 
397 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  31.71 
 
 
365 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  30.74 
 
 
345 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  30.74 
 
 
345 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  30.74 
 
 
345 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  30.74 
 
 
345 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  30.74 
 
 
345 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  31.54 
 
 
382 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  30.99 
 
 
383 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0299  tRNA/rRNA methyltransferase  33.14 
 
 
364 aa  94.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  28.51 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02475  predicted methyltransferase  29.46 
 
 
345 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.973085  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.46 
 
 
345 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0787829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1096  putative methyltransferase  29.46 
 
 
345 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00945167  normal  0.153252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2734  putative methyltransferase  29.46 
 
 
345 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00198303  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2955  putative methyltransferase  29.46 
 
 
345 aa  92.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  29.46 
 
 
345 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  29.46 
 
 
345 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  29.46 
 
 
345 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0729  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  31.28 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  27.13 
 
 
250 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.67 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.67 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.03 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.67 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  30.54 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  30.13 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  27.94 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  29.54 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  29.71 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.51 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  29.71 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.47 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.35 
 
 
249 aa  82  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  26.54 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  27.11 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0086  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.58 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.8 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  28.27 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.82 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1764  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.29 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.356011  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  26.25 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  33.17 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.92 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  33.68 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0363  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.75 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.39 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1268  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.11 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.81 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  25.33 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04047  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  27.92 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.92 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4740  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.92 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3833  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.92 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000869352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5696  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.92 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.46 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04009  hypothetical protein  27.92 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  28.65 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4651  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.92 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.326823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.27 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  26.69 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.92 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  28.05 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  26.69 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  26.83 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  28.51 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.5 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.5 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.35 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.5 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.15 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.2 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  28.26 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  28.26 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  27.42 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  24.23 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.58 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.97 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.5 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.16 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  27.23 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4711  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.08 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>