More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2526 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  100 
 
 		 333 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  46.2 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  46.9 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  41.84 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  44.79 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  41.54 
 
 		 388 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  42.48 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  48.31 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  49.38 
 
 		 365 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  47.33 
 
 		 345 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  39.7 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  47.33 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02475  predicted methyltransferase  39.7 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.973085  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.7 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0787829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2734  putative methyltransferase  39.7 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00198303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  39.7 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  39.7 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1096  putative methyltransferase  39.7 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00945167  normal  0.153252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2955  putative methyltransferase  39.7 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  47.33 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  47.33 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  47.33 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.46 
 
 		 278 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01826  tRNA/rRNA methyltransferase  41.95 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0299  tRNA/rRNA methyltransferase  36.63 
 
 		 364 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1790  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.55 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0549  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106936  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2713  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 255 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.3 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  34.15 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  34.68 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.1 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  30.64 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.2 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  29.29 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.15 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  28.99 
 
 		 323 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  30.89 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.78 
 
 		 652 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.04 
 
 		 249 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  29.27 
 
 		 245 aa  99  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.96 
 
 		 256 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  31.25 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  29.8 
 
 		 242 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  27.08 
 
 		 247 aa  98.2  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  31.8 
 
 		 536 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.53 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.04 
 
 		 248 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.58 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.14 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  27.62 
 
 		 256 aa  96.3  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1765  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.86 
 
 		 271 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.560778  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.42 
 
 		 254 aa  95.9  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.01 
 
 		 232 aa  95.9  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  29.17 
 
 		 251 aa  95.9  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.4 
 
 		 334 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.6 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  33.74 
 
 		 247 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  28.28 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.71 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.92 
 
 		 542 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.65 
 
 		 234 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  28.51 
 
 		 251 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.38 
 
 		 247 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.74 
 
 		 243 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.1 
 
 		 296 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.78 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.38 
 
 		 247 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  29.52 
 
 		 249 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  27.76 
 
 		 248 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  27.76 
 
 		 248 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  33.74 
 
 		 247 aa  92.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  29.5 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0219  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.37 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.62 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.21 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.21 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.21 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.21 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0526  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  23.18 
 
 		 246 aa  91.7  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.8 
 
 		 248 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.17 
 
 		 256 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.17 
 
 		 256 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.43 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.17 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2125  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.15 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  28.4 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.58 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 247 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0768  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.3 
 
 		 244 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.33 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>