More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1790 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1790  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0549  RNA methyltransferase  45.61 
 
 		 282 aa  182  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106936  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2713  RNA methyltransferase  36.8 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  37.55 
 
 		 333 aa  142  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  37.39 
 
 		 366 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  34.3 
 
 		 395 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  34.3 
 
 		 388 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  34.3 
 
 		 388 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  33.74 
 
 		 365 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.4 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  34.3 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  33.88 
 
 		 382 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  33.06 
 
 		 349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02475  predicted methyltransferase  31.84 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.973085  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.84 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0787829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2955  putative methyltransferase  31.84 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2734  putative methyltransferase  31.84 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00198303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  31.84 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  31.84 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  31.84 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1096  putative methyltransferase  31.84 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00945167  normal  0.153252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  33.06 
 
 		 397 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  32.65 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  32.24 
 
 		 345 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  32.24 
 
 		 345 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  32.24 
 
 		 345 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  32.24 
 
 		 345 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01826  tRNA/rRNA methyltransferase  34.32 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  31.82 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  29.15 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.77 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  32.64 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  29.3 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  31.05 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.64 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  28.44 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.58 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.73 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  30.84 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.1 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.76 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.27 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.3 
 
 		 652 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0299  tRNA/rRNA methyltransferase  29.92 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.7 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.95 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  33.5 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.57 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.54 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.57 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.22 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.22 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.22 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0310  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.87 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  33.5 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.26 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.64 
 
 		 542 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.34 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.22 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  37.09 
 
 		 372 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.92 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0619  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.13 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  35.38 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.78 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19440  rRNA methylase, putative, group 3  37.34 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0789  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.91 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3629  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0470316  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  35.45 
 
 		 323 aa  89  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.8 
 
 		 315 aa  89  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0086  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.21 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0658  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 271 aa  89  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3444  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.78 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.882432  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.17 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  32.89 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  36.57 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0768  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.11 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  34.57 
 
 		 536 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  32.2 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  33.33 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3601  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.36 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  28.44 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.4 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  26.82 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0306  TrmH family tRNA methyltransferase  31.11 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  28.9 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.16 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.24 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.22 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.36 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.17 
 
 		 234 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.71 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  32.57 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.57 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.43 
 
 		 416 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>