More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2860 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  99.71 
 
 		 345 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  100 
 
 		 345 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  99.71 
 
 		 345 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  99.71 
 
 		 345 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  99.13 
 
 		 345 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02475  predicted methyltransferase  87.25 
 
 		 345 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.973085  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  87.25 
 
 		 345 aa  631  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0787829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2734  putative methyltransferase  87.25 
 
 		 345 aa  631  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00198303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  87.25 
 
 		 345 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  87.25 
 
 		 345 aa  631  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1096  putative methyltransferase  87.25 
 
 		 345 aa  631  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00945167  normal  0.153252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2955  putative methyltransferase  87.25 
 
 		 345 aa  631  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  86.96 
 
 		 345 aa  630  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  77.26 
 
 		 365 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  63.79 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  60.31 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  60.52 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  59.07 
 
 		 383 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  59.59 
 
 		 388 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  62.87 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  58.29 
 
 		 395 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  57.89 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  47.33 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0299  tRNA/rRNA methyltransferase  41.63 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.41 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01826  tRNA/rRNA methyltransferase  40 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1790  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.65 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  31.98 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2713  RNA methyltransferase  30.74 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000150501  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0549  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.21 
 
 		 250 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  31.23 
 
 		 252 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.67 
 
 		 234 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  29.46 
 
 		 250 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  29.46 
 
 		 248 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  26.74 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.76 
 
 		 232 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 248 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  30.99 
 
 		 251 aa  90.1  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  29.05 
 
 		 248 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.7 
 
 		 652 aa  89.7  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  29.83 
 
 		 248 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.41 
 
 		 247 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.17 
 
 		 248 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  28.33 
 
 		 248 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0619  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.89 
 
 		 248 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.57 
 
 		 246 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  28.99 
 
 		 248 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.75 
 
 		 246 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  29.67 
 
 		 245 aa  85.9  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0729  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.16 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.57 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.68 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.16 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.16 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0683  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.44 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.427045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  27.62 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.57 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.14 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.16 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.16 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.76 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.87 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  29.46 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0526  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.22 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1489  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.34 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0887  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.04 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.4 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.16 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.05 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1105  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.98 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.919918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0991  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase, putative  30.98 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0139  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.88 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.01 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.63 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.63 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.97 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  26.43 
 
 		 536 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  29.67 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  29.1 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.04 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.45 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.74 
 
 		 246 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 260 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  30.67 
 
 		 247 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 247 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.05 
 
 		 246 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  31.77 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.47 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  31.77 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  28.81 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  28.4 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>