More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1731 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1731  RNA methyltransferase TrmH, group 3  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0696  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  87.04 
 
 
248 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  79.35 
 
 
248 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  76.02 
 
 
252 aa  401  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0619  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  76.45 
 
 
248 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  71.07 
 
 
247 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0533  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  72.61 
 
 
243 aa  346  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  40.74 
 
 
254 aa  175  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  35.1 
 
 
247 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.32 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.5 
 
 
256 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.5 
 
 
256 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40 
 
 
247 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  37.6 
 
 
248 aa  165  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.57 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  34.01 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  40.33 
 
 
249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  39.67 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  32.51 
 
 
289 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  37.65 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.42 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  32.1 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  39.58 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39 
 
 
250 aa  161  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  37.55 
 
 
263 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.25 
 
 
251 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  39.17 
 
 
248 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  38.37 
 
 
250 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.83 
 
 
250 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.76 
 
 
247 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.27 
 
 
261 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39 
 
 
255 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  38.33 
 
 
248 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  38.02 
 
 
248 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 
315 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  35.08 
 
 
249 aa  155  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  37.92 
 
 
248 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.65 
 
 
246 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  37.25 
 
 
248 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.92 
 
 
246 aa  154  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.84 
 
 
327 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  37.92 
 
 
248 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.65 
 
 
248 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2268  RNA methyltransferase  37.65 
 
 
248 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144304  normal  0.908224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
248 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  35.15 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.6 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.25 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.42 
 
 
246 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.78 
 
 
256 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0988  tRNA/rRNA methyltransferase  36.36 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.43 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  37.8 
 
 
243 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0869  RNA methyltransferase  36.36 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  34.16 
 
 
247 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.43 
 
 
247 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3029  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.73 
 
 
264 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.068461  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.86 
 
 
310 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  32.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  32.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  32.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  32.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  32.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1890  RNA methyltransferase  35.51 
 
 
253 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.575059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.29 
 
 
250 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  35.25 
 
 
244 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  36.93 
 
 
247 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35 
 
 
249 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.77 
 
 
248 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  35.08 
 
 
245 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.51 
 
 
247 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  35.44 
 
 
248 aa  148  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2929  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.1 
 
 
263 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.51 
 
 
251 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  33.74 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  36.55 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  37.71 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  37.24 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  37.24 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.29 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.96 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  37.08 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  33.61 
 
 
323 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.8 
 
 
255 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.74 
 
 
246 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  36.51 
 
 
247 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.27 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35 
 
 
246 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.27 
 
 
247 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  36.55 
 
 
242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.27 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  36.55 
 
 
242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.92 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0683  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.2 
 
 
255 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.427045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.69 
 
 
247 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>