More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1836 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1836  nickel transporter permease NikC  100 
 
 
277 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03327  nickel transporter subunit  90.61 
 
 
277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0237  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  90.61 
 
 
277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3677  nickel transporter permease NikC  90.97 
 
 
277 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03280  hypothetical protein  90.61 
 
 
277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3962  nickel transporter permease NikC  90.61 
 
 
277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3762  nickel transporter permease NikC  90.61 
 
 
277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0238  nickel transporter permease NikC  90.61 
 
 
277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4818  nickel transporter permease NikC  90.61 
 
 
277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3843  nickel transporter permease NikC  90.25 
 
 
277 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7616  nickel transporter permease NikC  64.73 
 
 
291 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0802  nickel transporter permease NikC  65.22 
 
 
290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0752  nickel transporter permease NikC  64.86 
 
 
290 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2275  nickel transporter permease NikC  69.8 
 
 
299 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0126063  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6074  nickel transporter permease NikC  57.89 
 
 
283 aa  284  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3007  nickel transporter permease NikC  65.16 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.524853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 
373 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1323  nickel transporter permease NikC  52.47 
 
 
277 aa  277  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00536272  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1030  nickel transporter permease NikC  52.38 
 
 
270 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3344  nickel transporter permease NikC  65.57 
 
 
281 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0349  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  43.68 
 
 
283 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.58 
 
 
300 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  40.45 
 
 
284 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
287 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
330 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.540099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.3 
 
 
292 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
295 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
310 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
301 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  42.59 
 
 
301 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0470  nickel ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 
290 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
309 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
303 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
307 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
300 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.31 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0718  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2420  dipeptide ABC transport system inner membrane binding component DppC  40.64 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000767733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.69 
 
 
288 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
311 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.23044 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.74 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04500  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.83 
 
 
278 aa  195  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0927  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
284 aa  195  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0968091  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.5 
 
 
295 aa  195  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
304 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.637669  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  42.05 
 
 
300 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
300 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
290 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.58 
 
 
296 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.232197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
289 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
310 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
301 aa  191  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
301 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  39.34 
 
 
295 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
301 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
286 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
305 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  39.83 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0275  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 
283 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.609618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
312 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
294 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58779  normal  0.456296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
301 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
285 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  38.85 
 
 
303 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  39.53 
 
 
282 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.23 
 
 
303 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  37.16 
 
 
298 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
303 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2115  peptide ABC transporter membrane protein  40.41 
 
 
286 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  40.23 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  37.16 
 
 
298 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  37.16 
 
 
298 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  38.85 
 
 
303 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
305 aa  187  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  37.16 
 
 
298 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
274 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  37.16 
 
 
298 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1748  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  38.7 
 
 
294 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.161109  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
303 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
308 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  39.23 
 
 
303 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  40.23 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>