258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3926 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3926  putative fimbrial usher protein FanD  100 
 
 		 785 aa  1606    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.540204 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4579  CshB porin  31.36 
 
 		 812 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.363192 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.32 
 
 		 850 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  27.23 
 
 		 833 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  27.23 
 
 		 850 aa  226  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  27.35 
 
 		 833 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  27.48 
 
 		 833 aa  225  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.31 
 
 		 871 aa  222  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.71 
 
 		 866 aa  220  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.05 
 
 		 837 aa  218  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.34 
 
 		 832 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  28.89 
 
 		 838 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.3 
 
 		 861 aa  214  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  28.35 
 
 		 842 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  28.35 
 
 		 842 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  29.02 
 
 		 838 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  29.02 
 
 		 838 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  28.35 
 
 		 842 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  29.02 
 
 		 838 aa  213  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.63 
 
 		 838 aa  212  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  28.76 
 
 		 863 aa  211  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.31 
 
 		 835 aa  211  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.35 
 
 		 867 aa  210  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  24.71 
 
 		 816 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.63 
 
 		 838 aa  208  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.84 
 
 		 837 aa  207  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.05 
 
 		 844 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  26.3 
 
 		 829 aa  205  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  26.22 
 
 		 829 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  24.94 
 
 		 837 aa  204  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.94 
 
 		 819 aa  203  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  24.94 
 
 		 833 aa  203  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.37 
 
 		 870 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  24.81 
 
 		 833 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  25.83 
 
 		 854 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.96 
 
 		 863 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  27.37 
 
 		 870 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.93 
 
 		 851 aa  201  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.99 
 
 		 831 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  24.71 
 
 		 816 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.74 
 
 		 840 aa  200  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.48 
 
 		 818 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.94 
 
 		 846 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  24.71 
 
 		 792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.01 
 
 		 1040 aa  200  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  25.83 
 
 		 854 aa  200  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.88 
 
 		 828 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  27.46 
 
 		 885 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  27.46 
 
 		 885 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.95 
 
 		 826 aa  198  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  25.81 
 
 		 826 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  27.79 
 
 		 885 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  24.68 
 
 		 833 aa  197  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2245  fimbrial usher protein  24.94 
 
 		 826 aa  197  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.141315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.38 
 
 		 859 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  27.33 
 
 		 885 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.97 
 
 		 826 aa  196  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.97 
 
 		 826 aa  196  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.28 
 
 		 852 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  25.74 
 
 		 872 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.58 
 
 		 844 aa  195  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  26.66 
 
 		 871 aa  195  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1455  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.79 
 
 		 841 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  26.58 
 
 		 848 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.31 
 
 		 857 aa  194  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  25.22 
 
 		 868 aa  193  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3092  fimbrial usher protein  24.44 
 
 		 826 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  25.56 
 
 		 822 aa  193  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  25.83 
 
 		 826 aa  193  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.57 
 
 		 872 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  24.91 
 
 		 870 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  24.97 
 
 		 826 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.37 
 
 		 832 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  25.59 
 
 		 834 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.56 
 
 		 817 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.81 
 
 		 963 aa  191  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  24.91 
 
 		 870 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  24.85 
 
 		 826 aa  191  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  24.91 
 
 		 870 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  26.3 
 
 		 848 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.43 
 
 		 887 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  25.34 
 
 		 833 aa  191  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  24.85 
 
 		 870 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  25.41 
 
 		 840 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.77 
 
 		 865 aa  190  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  26.79 
 
 		 881 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  27.19 
 
 		 880 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  27.32 
 
 		 880 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  24.79 
 
 		 870 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  25.92 
 
 		 866 aa  189  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.21 
 
 		 828 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.04 
 
 		 828 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  26.14 
 
 		 848 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  26.04 
 
 		 848 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  25.78 
 
 		 829 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  25.66 
 
 		 829 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  25.77 
 
 		 812 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  27.09 
 
 		 881 aa  188  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.77 
 
 		 821 aa  188  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.9 
 
 		 828 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>