266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0954 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0954  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
160 aa  317  5e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0167  50S ribosomal protein L10  93.12 
 
 
160 aa  300  7.000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0022  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 
172 aa  121  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  34.04 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  30.19 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  33.1 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  31.61 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  30.13 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  30.13 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  31.87 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  29.87 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  29.79 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  33.57 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  29.08 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  33.57 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  32.12 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  32.87 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  28.37 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  28.37 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  29.08 
 
 
172 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  27.66 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  28.37 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  27.66 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  26.92 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  27.1 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  27.74 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  28.75 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  26.95 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0172  50S ribosomal protein L10  27.5 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.33126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  26.24 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  27.66 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  25.53 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  28.37 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  27.66 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  28.37 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1458  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000221032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0526  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.142497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  28.37 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  29.08 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0507  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000655679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  29.08 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  32.14 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  27.7 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  27.21 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  24.65 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  28.66 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  25.62 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  28.66 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  29.05 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  26.95 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  27.46 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  28.85 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  26.76 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  24.39 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0234  ribosomal protein L10  30.07 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.675629  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1318  50S ribosomal protein L10  26.25 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000548659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  27.04 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  30.49 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  28.17 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  27.54 
 
 
165 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  28.4 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  27.54 
 
 
165 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  27.54 
 
 
165 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  27.27 
 
 
176 aa  60.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  29.03 
 
 
174 aa  60.8  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  25 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  28.46 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  26.76 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  28.46 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  29.2 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  29.45 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  24.39 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  26.24 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  31.54 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  29.56 
 
 
177 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  26.95 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  29.68 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  26.24 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  29.27 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  29.27 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  28.46 
 
 
174 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  29.27 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  27.66 
 
 
170 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  29.27 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  28.23 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  28.93 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  29.69 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  28.17 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  29.29 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  29.29 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  28.89 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  31.45 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  29.08 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  29.08 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  29.08 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  24.64 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  29.08 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>