164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0636 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0636  cytochrome c biogenesis family protein  100 
 
 		 134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0517419  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH, putative  77.44 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.216277  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0844  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH, putative  52.83 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3992  cytochrome C biogenesis protein  35.19 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_004310  BR0610  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  30.47 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  31.15 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3777  cytochrome C biogenesis protein  34.29 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4053  cytochrome C biogenesis protein  34.29 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.448271  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1376  cytochrome C biogenesis protein  34.13 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3409  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  32.43 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0284727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0439  cytochrome C biogenesis protein  34.82 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3447  cytochrome C biogenesis protein  32.48 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.345462  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2004  cytochrome C biogenesis protein  30.25 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2392  cytochrome c biogenesis protein  34.23 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00556293  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0433  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  37.37 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2668  cytochrome C biogenesis protein  31.13 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3890  cytochrome C biogenesis protein  36 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0293402  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0942  cytochrome C biogenesis protein  32 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0762441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1194  cytochrome C biogenesis protein  34 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0923  cytochrome C biogenesis protein  30.25 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353367  normal  0.0366551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2274  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH precursor  34.71 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1365  cycL protein  32.2 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00486765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0636  cytochrome C biogenesis protein  29.36 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0033  cytochrome C biogenesis protein  32.38 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00807478  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1440  cytochrome C biogenesis protein  33 
 
 		 195 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0900  cytochrome C biogenesis protein  31.25 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198735  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1511  cytochrome C biogenesis protein  36.67 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2233  cytochrome C biogenesis protein  37.63 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1657  cytochrome C biogenesis protein  32.8 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.282242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2706  cytochrome C biogenesis protein  30 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1128  cytochrome C biogenesis protein  31.53 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1072  cytochrome C biogenesis protein  30.48 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.777524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2133  cytochrome C biogenesis protein  31.68 
 
 		 165 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2930  cytochrome C biogenesis protein  29.91 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.344333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4165  cytochrome C biogenesis protein  30.43 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2856  cytochrome C biogenesis protein  34.44 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4994  cytochrome C biogenesis protein  32.65 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039683 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0376  putative cytochrome C biogenesis protein CcmH  25.22 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0115761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1170  cytochrome C biogenesis protein  32.26 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0925  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  34.44 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0894  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  34.44 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3564  cytochrome C biogenesis protein  27.64 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000181195  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1514  cytochrome C biogenesis protein  39.24 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.730771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0195  cytochrome C biogenesis protein  31.2 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00319967  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2634  cytochrome c maturation protein, CcmH  32.97 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0250  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  30.08 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000345398  normal  0.0777875 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2854  cytochrome C biogenesis protein  32.26 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3249  cytochrome C biogenesis protein  27.97 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3384  cytochrome C biogenesis protein  33.33 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3017  cytochrome C biogenesis protein  33.05 
 
 		 180 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1371  cytochrome C biogenesis protein  31.11 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1291  cytochrome C biogenesis protein  32.97 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3998  cytochrome C biogenesis protein  30.21 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal  0.946907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03067  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  29.06 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4430  cytochrome C biogenesis protein  31.4 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0038  cytochrome C biogenesis protein  27.12 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1837  cytochrome C biogenesis protein  33.33 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0302505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0339  cytochrome C biogenesis protein  35.71 
 
 		 361 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 		 344 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0486  cytochrome C biogenesis protein  26.88 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2448  cytochrome C biogenesis protein  31.87 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3997  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3978  cytochrome C biogenesis protein  24.76 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.297703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1207  cytochrome C biogenesis protein  30.85 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1508  cytochrome C biogenesis protein  32.77 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1638  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  28.45 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00720006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0941  cytochrome C biogenesis protein  34.12 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0853433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02121  heme lyase, CcmH subunit  30 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1465  cytochrome C biogenesis protein  30 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1456  cytochrome C biogenesis protein  30 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0747  cytochrome c-type biogenesis family protein  30 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1503  cytochrome C biogenesis protein  31.86 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0583  cytochrome C biogenesis protein  29.76 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.176741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02080  hypothetical protein  30 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1394  putative cytochrome c-type biogenesis protein  31.86 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2332  cytochrome c-type biogenesis family protein  30 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2493  cytochrome c-type biogenesis family protein  30 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3331  cytochrome c-type biogenesis family protein  30 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2342  cytochrome c-type biogenesis family protein  30 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4654  cytochrome c nitrite reductase, accessory protein NrfF  26.45 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532931  normal  0.0226241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4772  cytochrome C biogenesis protein  25.23 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1551  cytochrome C biogenesis protein  32.91 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.280563 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0400  cytochrome c-type biogenesis protein H  28.7 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3074  cytochrome c-type biogenesis protein cycL precursor  33.75 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002848  cytochrome c heme lyase subunit CcmL  27.64 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1658  cytochrome C biogenesis protein  32.18 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242206  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1400  cytochrome C biogenesis protein  30.48 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287486  normal  0.0562024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1741  cytochrome C biogenesis protein  25.6 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0074582  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0487  cytochrome C biogenesis protein  29.11 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1680  cytochrome C biogenesis protein  31.43 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.456751 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003120  cytochrome c-type heme lyase subunit nrfF nitrite reductase complex assembly  35.9 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1413  cytochrome C biogenesis protein  29.27 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.638624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3408  cytochrome C biogenesis protein  24.8 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.572276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0220  cytochrome C biogenesis protein  31.15 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000296906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1559  cytochrome C-type biogenesis protein  27.73 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000529963  normal  0.148029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45290  cytochrome C-type biogenesis protein CcmH  29.73 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3845  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  29.73 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4282  cytochrome c biogenesis protein  28.04 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100149  normal  0.0369592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1405  cytochrome C biogenesis protein  31.43 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.469945  normal  0.0182581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2487  cytochrome c-type biogenesis protein H2  34.52 
 
 		 347 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  hitchhiker  0.00973673 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>