177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0610 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0610  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  100 
 
 
158 aa  315  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  99.37 
 
 
158 aa  312  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2668  cytochrome C biogenesis protein  75.32 
 
 
158 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0636  cytochrome C biogenesis protein  66.91 
 
 
151 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141803  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1365  cycL protein  63.43 
 
 
152 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00486765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0923  cytochrome C biogenesis protein  56.95 
 
 
153 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353367  normal  0.0366551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0900  cytochrome C biogenesis protein  59.33 
 
 
153 aa  172  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1072  cytochrome C biogenesis protein  62.31 
 
 
151 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.777524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0439  cytochrome C biogenesis protein  56.62 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1658  cytochrome C biogenesis protein  62.31 
 
 
162 aa  150  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242206  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2004  cytochrome C biogenesis protein  51.57 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2233  cytochrome C biogenesis protein  56.93 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3447  cytochrome C biogenesis protein  56.2 
 
 
166 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.345462  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0942  cytochrome C biogenesis protein  51.91 
 
 
157 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0762441  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4994  cytochrome C biogenesis protein  69.07 
 
 
154 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2634  cytochrome c maturation protein, CcmH  54.41 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1291  cytochrome C biogenesis protein  54.41 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2133  cytochrome C biogenesis protein  63.46 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663387  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1170  cytochrome C biogenesis protein  58.78 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1837  cytochrome C biogenesis protein  62.04 
 
 
166 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0302505  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3777  cytochrome C biogenesis protein  53.03 
 
 
157 aa  137  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1128  cytochrome C biogenesis protein  53.57 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4053  cytochrome C biogenesis protein  53.03 
 
 
157 aa  137  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.448271  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0433  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  58.77 
 
 
147 aa  136  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2930  cytochrome C biogenesis protein  52 
 
 
157 aa  134  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.344333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3409  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  47.44 
 
 
161 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0284727  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4165  cytochrome C biogenesis protein  69.23 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1400  cytochrome C biogenesis protein  56.92 
 
 
153 aa  133  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287486  normal  0.0562024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1680  cytochrome C biogenesis protein  53.02 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.456751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1405  cytochrome C biogenesis protein  53.69 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.469945  normal  0.0182581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1440  cytochrome C biogenesis protein  56.03 
 
 
195 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0033  cytochrome C biogenesis protein  50 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00807478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1194  cytochrome C biogenesis protein  54.23 
 
 
187 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3890  cytochrome C biogenesis protein  54.14 
 
 
151 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0293402  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4430  cytochrome C biogenesis protein  65.56 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3074  cytochrome c-type biogenesis protein cycL precursor  61.29 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3978  cytochrome C biogenesis protein  51.49 
 
 
150 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.297703  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2153  cytochrome C biogenesis protein  63.95 
 
 
158 aa  121  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3998  cytochrome C biogenesis protein  42.31 
 
 
162 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal  0.946907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1584  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase, 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  45.07 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.550615  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0250  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  39.49 
 
 
167 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000345398  normal  0.0777875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4019  cytochrome c nitrite reductase, accessory protein NrfF  37.41 
 
 
159 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000231176  hitchhiker  0.00651067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0233  cytochrome C biogenesis protein  37.41 
 
 
159 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000146648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0233  cytochrome C biogenesis protein  37.41 
 
 
159 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000012356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0236  cytochrome C biogenesis protein  37.41 
 
 
159 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000417062  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0195  cytochrome C biogenesis protein  43.22 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00319967  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45290  cytochrome C-type biogenesis protein CcmH  43.57 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3386  cytochrome C biogenesis protein  41.33 
 
 
156 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.255579  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3997  transcriptional regulator, XRE family  55.21 
 
 
201 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3845  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  43.8 
 
 
155 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1511  cytochrome C biogenesis protein  43.55 
 
 
160 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3722  cytochrome C biogenesis protein  38.24 
 
 
159 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000413859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30380  Cytochrome C biogenesis protein  41.61 
 
 
157 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3564  cytochrome C biogenesis protein  34.42 
 
 
159 aa  104  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000181195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4654  cytochrome c nitrite reductase, accessory protein NrfF  40.14 
 
 
160 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532931  normal  0.0226241 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1376  cytochrome C biogenesis protein  39.69 
 
 
157 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0220  cytochrome C biogenesis protein  43.33 
 
 
155 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000296906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0941  cytochrome C biogenesis protein  43.2 
 
 
153 aa  100  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0853433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1551  cytochrome C biogenesis protein  52 
 
 
179 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.280563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1207  cytochrome C biogenesis protein  41.86 
 
 
182 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2706  cytochrome C biogenesis protein  47.17 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572968  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1657  cytochrome C biogenesis protein  44.97 
 
 
159 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.282242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2856  cytochrome C biogenesis protein  50 
 
 
163 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00220  C-type cytochrome biogenesis protein  43.64 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002848  cytochrome c heme lyase subunit CcmL  35.95 
 
 
161 aa  99  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1503  cytochrome C biogenesis protein  41.13 
 
 
170 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1394  putative cytochrome c-type biogenesis protein  41.13 
 
 
170 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4282  cytochrome c biogenesis protein  44.92 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100149  normal  0.0369592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0583  cytochrome C biogenesis protein  44.92 
 
 
133 aa  97.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.176741  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1638  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  38.1 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00720006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03128  hypothetical protein  38.16 
 
 
161 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3889  cytochrome C biogenesis protein  42.74 
 
 
158 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200092  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0376  putative cytochrome C biogenesis protein CcmH  39.2 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0115761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0184  cytochrome C biogenesis protein  36.13 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2784  cytochrome C biogenesis protein  40.26 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1547  cytochrome C biogenesis protein  41.67 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89149  normal  0.744537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2854  cytochrome C biogenesis protein  40 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3628  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  44.92 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2392  cytochrome c biogenesis protein  44.55 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00556293  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2448  cytochrome C biogenesis protein  40.91 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0038  cytochrome C biogenesis protein  38.64 
 
 
155 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1413  cytochrome C biogenesis protein  36.99 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.638624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2274  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH precursor  36.18 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1209  C-type cytochrome biogenesis protein  46.24 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH, putative  34.85 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.216277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1689  cytochrome C biogenesis protein  43.86 
 
 
167 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.320288  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0925  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  42.86 
 
 
133 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0894  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  42.86 
 
 
133 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3992  cytochrome C biogenesis protein  39.62 
 
 
178 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  38.35 
 
 
344 aa  87.8  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00858  C-type cytochrome biogenesis protein  49.02 
 
 
143 aa  87  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00749926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06069  C-type cytochrome biogenesis protein  49.02 
 
 
143 aa  87  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000842806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3384  cytochrome C biogenesis protein  40 
 
 
157 aa  87  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1877  cytochrome C-type biogenesis protein CcmH  36.96 
 
 
147 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542623  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1037  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  36.77 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0400  cytochrome c-type biogenesis protein H  37.7 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3408  cytochrome C biogenesis protein  41.24 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.572276  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0231  cytochrome C biogenesis protein  39.42 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000238711  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3017  cytochrome C biogenesis protein  33.55 
 
 
180 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1465  cytochrome C biogenesis protein  37.7 
 
 
350 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>