177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1680 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1680  cytochrome C biogenesis protein  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.456751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1405  cytochrome C biogenesis protein  98.69 
 
 		 153 aa  303  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.469945  normal  0.0182581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1400  cytochrome C biogenesis protein  89.54 
 
 		 153 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287486  normal  0.0562024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4994  cytochrome C biogenesis protein  76.15 
 
 		 154 aa  173  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039683 
 
 
-
 
NC_004310  BR0610  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  54.36 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0900  cytochrome C biogenesis protein  54.05 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  54.36 
 
 		 158 aa  153  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3447  cytochrome C biogenesis protein  62.6 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.345462  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4165  cytochrome C biogenesis protein  74.73 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4430  cytochrome C biogenesis protein  75.56 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2004  cytochrome C biogenesis protein  60.32 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1658  cytochrome C biogenesis protein  59.85 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242206  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1837  cytochrome C biogenesis protein  56.33 
 
 		 166 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0302505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0636  cytochrome C biogenesis protein  57.25 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0923  cytochrome C biogenesis protein  54.81 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353367  normal  0.0366551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1365  cycL protein  57.86 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00486765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1072  cytochrome C biogenesis protein  54.55 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.777524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2634  cytochrome c maturation protein, CcmH  53.68 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0439  cytochrome C biogenesis protein  52.63 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1291  cytochrome C biogenesis protein  53.68 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2133  cytochrome C biogenesis protein  61.16 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2668  cytochrome C biogenesis protein  52.17 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3409  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  47.71 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0284727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2233  cytochrome C biogenesis protein  50 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0942  cytochrome C biogenesis protein  55.81 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0762441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1194  cytochrome C biogenesis protein  68.97 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1170  cytochrome C biogenesis protein  57.69 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1440  cytochrome C biogenesis protein  64.21 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0433  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  56.36 
 
 		 147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4053  cytochrome C biogenesis protein  45.33 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.448271  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3777  cytochrome C biogenesis protein  45.33 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3074  cytochrome c-type biogenesis protein cycL precursor  68.67 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1128  cytochrome C biogenesis protein  47.1 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2153  cytochrome C biogenesis protein  50 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3890  cytochrome C biogenesis protein  50.76 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0293402  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0033  cytochrome C biogenesis protein  46.92 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00807478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3998  cytochrome C biogenesis protein  47.2 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal  0.946907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2930  cytochrome C biogenesis protein  45.1 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.344333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2784  cytochrome C biogenesis protein  43.92 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002848  cytochrome c heme lyase subunit CcmL  41.72 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45290  cytochrome C-type biogenesis protein CcmH  40.91 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03128  hypothetical protein  41.5 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1207  cytochrome C biogenesis protein  44 
 
 		 182 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0925  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  44.83 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0894  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  44.83 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3978  cytochrome C biogenesis protein  44.7 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.297703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0941  cytochrome C biogenesis protein  41.67 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0853433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3845  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  44.26 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2856  cytochrome C biogenesis protein  55.17 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30380  Cytochrome C biogenesis protein  44.27 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404014  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1376  cytochrome C biogenesis protein  40.14 
 
 		 157 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1547  cytochrome C biogenesis protein  40 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89149  normal  0.744537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3997  transcriptional regulator, XRE family  54.74 
 
 		 201 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0376  putative cytochrome C biogenesis protein CcmH  47 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0115761 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1638  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  39.31 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00720006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02121  heme lyase, CcmH subunit  45.83 
 
 		 350 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1465  cytochrome C biogenesis protein  45.83 
 
 		 350 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1456  cytochrome C biogenesis protein  45.83 
 
 		 350 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02080  hypothetical protein  45.83 
 
 		 350 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3331  cytochrome c-type biogenesis family protein  45.83 
 
 		 350 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1657  cytochrome C biogenesis protein  49.32 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.282242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2342  cytochrome c-type biogenesis family protein  45.83 
 
 		 350 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2332  cytochrome c-type biogenesis family protein  45.83 
 
 		 350 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2493  cytochrome c-type biogenesis family protein  45.83 
 
 		 350 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0747  cytochrome c-type biogenesis family protein  45.83 
 
 		 350 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238814  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2854  cytochrome C biogenesis protein  45.79 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3384  cytochrome C biogenesis protein  44.44 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3889  cytochrome C biogenesis protein  38.62 
 
 		 158 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3408  cytochrome C biogenesis protein  41.41 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.572276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0184  cytochrome C biogenesis protein  39.17 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0250  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  39.5 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000345398  normal  0.0777875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1503  cytochrome C biogenesis protein  42.5 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1394  putative cytochrome c-type biogenesis protein  42.5 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0236  cytochrome C biogenesis protein  33.76 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000417062  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2392  cytochrome c biogenesis protein  44 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00556293  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2448  cytochrome C biogenesis protein  49.46 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0583  cytochrome C biogenesis protein  48.08 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.176741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0233  cytochrome C biogenesis protein  33.76 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000146648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0233  cytochrome C biogenesis protein  33.76 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000012356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4019  cytochrome c nitrite reductase, accessory protein NrfF  33.76 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000231176  hitchhiker  0.00651067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3722  cytochrome C biogenesis protein  34.23 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000413859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0038  cytochrome C biogenesis protein  40 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4654  cytochrome c nitrite reductase, accessory protein NrfF  34.39 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532931  normal  0.0226241 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1209  C-type cytochrome biogenesis protein  48.42 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1584  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase, 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  38.06 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.550615  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3017  cytochrome C biogenesis protein  40.48 
 
 		 180 aa  90.1  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3386  cytochrome C biogenesis protein  47.12 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.255579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0195  cytochrome C biogenesis protein  36.24 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00319967  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1511  cytochrome C biogenesis protein  40.83 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2473  cytochrome c-type biogenesis protein H2  43.75 
 
 		 347 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.677618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4023  cytochrome c-type biogenesis protein H2  43.86 
 
 		 347 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4144  cytochrome c-type biogenesis protein H2  43.86 
 
 		 347 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2487  cytochrome c-type biogenesis protein H2  43.86 
 
 		 347 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  hitchhiker  0.00973673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3564  cytochrome C biogenesis protein  32.47 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000181195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0220  cytochrome C biogenesis protein  35.33 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000296906  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2382  cytochrome c-type biogenesis protein H1  42.98 
 
 		 347 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2590  cytochrome c-type biogenesis protein H2  43.36 
 
 		 347 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.124545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4202  cytochrome c-type biogenesis protein H2  43.36 
 
 		 347 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3249  cytochrome C biogenesis protein  36.05 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2431  cytochrome c-type biogenesis protein H2  43.36 
 
 		 347 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.684186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>