More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0477 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0477  ABC transporter related  100 
 
 
269 aa  531  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0153416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1317  ABC transporter related  60.69 
 
 
251 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2953  ATPase  52.63 
 
 
243 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0538  ABC transporter, ATPase subunit  49.06 
 
 
242 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0570  ABC transporter-related protein  48.68 
 
 
242 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0567  ABC transporter related  50 
 
 
242 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.579035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.07 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.5 
 
 
285 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.12 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  30.19 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.46 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.06 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.65 
 
 
288 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.17 
 
 
286 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.84 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  32.38 
 
 
255 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.67 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 
274 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  29.67 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.52 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 
272 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  33.46 
 
 
277 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 
308 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  32.53 
 
 
284 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.9 
 
 
244 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  30.4 
 
 
242 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.57 
 
 
247 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  27.49 
 
 
271 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  30.04 
 
 
288 aa  105  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 
249 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1650  ABC transporter, ATP-binding protein  26.8 
 
 
246 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000259344  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.42 
 
 
627 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  29.05 
 
 
248 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  30.08 
 
 
284 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.24 
 
 
403 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.3 
 
 
810 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0775  ABC transporter related  32.5 
 
 
243 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  27.55 
 
 
282 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  35.06 
 
 
252 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  32.14 
 
 
252 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.18 
 
 
395 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  31.98 
 
 
271 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  36.19 
 
 
582 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.64 
 
 
281 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  26.54 
 
 
281 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  29.82 
 
 
231 aa  102  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  30.74 
 
 
264 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  35.44 
 
 
373 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.69 
 
 
278 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 
274 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.83 
 
 
453 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1236  ABC transporter related protein  29.06 
 
 
245 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.839262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  28.46 
 
 
398 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.24 
 
 
406 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 
402 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.05 
 
 
305 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  32.05 
 
 
325 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1927  ABC transporter related  29.01 
 
 
277 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.08 
 
 
411 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  25.19 
 
 
278 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.52 
 
 
541 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  37.24 
 
 
214 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.18 
 
 
340 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  30.57 
 
 
276 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  31.37 
 
 
352 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.89 
 
 
280 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  33.72 
 
 
260 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  32.68 
 
 
289 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  34.76 
 
 
343 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.76 
 
 
343 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.29 
 
 
293 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.76 
 
 
343 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  28.23 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.96 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  27.42 
 
 
566 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0624  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.55 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.458442  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  36.36 
 
 
504 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  30.74 
 
 
364 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  26.72 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0540  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.84 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  29.79 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.83 
 
 
566 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.59 
 
 
363 aa  99.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  35.16 
 
 
232 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.74 
 
 
356 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  32.93 
 
 
276 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 
566 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  29.76 
 
 
278 aa  99  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  27.44 
 
 
283 aa  99  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  27.44 
 
 
283 aa  99  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  29.49 
 
 
271 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  29.34 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.25 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27 
 
 
566 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  30.47 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  32.13 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2617  ABC transporter related protein  31.54 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.35 
 
 
458 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1742  ABC transporter related  36 
 
 
239 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.602856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>