More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1317 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1317  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0477  ABC transporter related  59.92 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153416 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2953  ATPase  60.8 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0538  ABC transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 		 242 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0570  ABC transporter-related protein  50.8 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0567  ABC transporter related  52.23 
 
 		 242 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.579035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.88 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  32.07 
 
 		 274 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  35.09 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1087  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.65 
 
 		 288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.64 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1650  ABC transporter, ATP-binding protein  29.87 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.71 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  38.1 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.9 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.84 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4184  daunorubicin resistance ABC transporter ATP- binding subunit  37.38 
 
 		 328 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00696491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  31.3 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  35.62 
 
 		 307 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.81 
 
 		 351 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.18 
 
 		 403 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.93 
 
 		 312 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.4 
 
 		 395 aa  106  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  28.46 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  36.28 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.51 
 
 		 541 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.78 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0540  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.21 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1927  ABC transporter related  31.02 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.33 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  31.17 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.91 
 
 		 402 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  35.93 
 
 		 373 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 		 453 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2617  ABC transporter related protein  34.31 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  27.06 
 
 		 440 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.93 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  30.9 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  39.42 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.98 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.96 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.73 
 
 		 495 aa  102  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.86 
 
 		 305 aa  101  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  37.93 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.91 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.56 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  33.89 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  37.95 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 		 362 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.82 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.7 
 
 		 406 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.34 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  30 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0624  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.19 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.458442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6125  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.65 
 
 		 403 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  30.09 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 		 270 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  35.55 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  30.36 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.89 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0726  ABC transporter related  29.09 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.904446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  28.51 
 
 		 568 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  34.2 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.14 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  30.36 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  30.36 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.14 
 
 		 590 aa  99.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  29.87 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 318 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  31.16 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  31.36 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  35.19 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 		 320 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  39.59 
 
 		 232 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  39.59 
 
 		 232 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 		 279 aa  98.6  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.19 
 
 		 332 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.48 
 
 		 636 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.48 
 
 		 636 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  34.29 
 
 		 337 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.48 
 
 		 636 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  32.88 
 
 		 269 aa  98.6  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  33.48 
 
 		 636 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  34.12 
 
 		 374 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  36.71 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  33.48 
 
 		 636 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.48 
 
 		 636 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  34.29 
 
 		 337 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  30.96 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.85 
 
 		 288 aa  97.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  29.44 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>