More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2953 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2953  ATPase  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1317  ABC transporter related  60.8 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0538  ABC transporter, ATPase subunit  50.62 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0477  ABC transporter related  53.01 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0570  ABC transporter-related protein  50.62 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0567  ABC transporter related  53.7 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.579035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.34 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  35.95 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  33.47 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.04 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.02 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1650  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.95 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.35 
 
 		 402 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  40.57 
 
 		 491 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2142  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.2 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2189  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.2 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2355  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.2 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142366 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.99 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2242  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.2 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  normal  0.066673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2196  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.2 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.04 
 
 		 398 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.34 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.64 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  28.92 
 
 		 440 aa  115  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  34.84 
 
 		 309 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  28.69 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  33.33 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.93 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  30.17 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1742  ABC transporter related  38.53 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.602856  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  33.74 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.92 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  34.56 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1927  ABC transporter related  34.51 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.07 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  32.89 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 		 395 aa  111  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 566 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.09 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  32.14 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.28 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.61 
 
 		 403 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.04 
 
 		 553 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.54 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6452  ABC(ATP-binding) family transporter: cobalt ion  37.05 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1166  ABC transporter related  34.6 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00292656  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1087  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.6 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  33.77 
 
 		 531 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  35.21 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  33.94 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  30.8 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  32.24 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  40.5 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 		 411 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.07 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.35 
 
 		 283 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.37 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  34.47 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  28.29 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.82 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  33.04 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  29.76 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 		 280 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.09 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 		 280 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0153  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.68 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1113499999999999e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  39.91 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  33.8 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.81 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 		 300 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 		 300 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  33.49 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  35.87 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  27.8 
 
 		 281 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 		 300 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.57 
 
 		 566 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  33.5 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  30.17 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  30.17 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  35.43 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.9 
 
 		 495 aa  108  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  30.42 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.19 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 		 566 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  34.89 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  36.21 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.07 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>