More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0889 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0889  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00411126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  64.56 
 
 
86 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  74.32 
 
 
86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  71.05 
 
 
87 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  66.2 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  60.27 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  53.25 
 
 
82 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  54.05 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  56.76 
 
 
87 aa  90.5  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  52.7 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  62.86 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  50.54 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  56.72 
 
 
76 aa  88.6  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  64.62 
 
 
70 aa  88.6  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  54.76 
 
 
88 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  60.66 
 
 
206 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  60.66 
 
 
214 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  52.05 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  60.29 
 
 
74 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.95 
 
 
75 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  61.19 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  52.94 
 
 
85 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  52.94 
 
 
85 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  58.82 
 
 
97 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  47.87 
 
 
132 aa  87  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
136 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  52.94 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  52.94 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  59.42 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  57.53 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  53.42 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  58.57 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  53.42 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  62.3 
 
 
64 aa  84.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  54.05 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  53.52 
 
 
72 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  54.43 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 
85 aa  84  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  57.97 
 
 
95 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 
80 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  54.05 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  50.68 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
79 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
79 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  48.65 
 
 
77 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 
98 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  50.7 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  47.06 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  55.71 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  58.82 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
76 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
76 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  55.07 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  58.21 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  57.81 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  59.02 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  50.68 
 
 
74 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  52.94 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.58 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  52.94 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  51.47 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  62.3 
 
 
79 aa  80.1  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  53.42 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  57.35 
 
 
76 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.13 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  47.13 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  48 
 
 
81 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  52.11 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  55.88 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  47.37 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 
79 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  51.47 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
68 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  57.38 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  55.07 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  51.52 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  53.62 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  56.45 
 
 
75 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  53.62 
 
 
72 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  49.3 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  52.24 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>