37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3713 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  38.32 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  43.27 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  42.72 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  30.72 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  34.71 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  34.82 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  38.24 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  36.04 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  33.79 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  27.19 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  34.82 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  33.87 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  37.25 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  33.88 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  27.62 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  35.2 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  36.27 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  34.31 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  30.28 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  27.81 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  36.28 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  28.28 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  29.31 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  28.46 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  35.24 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  26.56 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  30.97 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  34.75 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>