32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3137 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  335  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  48.65 
 
 
147 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  49.07 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  46.85 
 
 
160 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  48.15 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  41.74 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  46.3 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  40.46 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  39.69 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  45.28 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  42.16 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  43.27 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  40.82 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  37.01 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  34.46 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  34.4 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  39.29 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  41.28 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  38.83 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  33.11 
 
 
171 aa  57.8  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  38.05 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  37.86 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  35.88 
 
 
167 aa  55.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  31.69 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  35.78 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  32.08 
 
 
198 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  38.24 
 
 
187 aa  51.2  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0472  hypothetical protein  32.73 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  40.91 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  30.38 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  32.69 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.321076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>