32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7537 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  362  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  36.03 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  33.57 
 
 		 198 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  31.13 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  34.55 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  38 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  36.89 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  30.14 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  38.54 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  36.94 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  32.41 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  33.54 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  35.16 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  31.5 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  34.72 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  35.45 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  29.81 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  33.94 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  32.41 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  28.83 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  30.14 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  32.26 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  30.63 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  24.82 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3590  hypothetical protein  24.67 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000185848  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  25.86 
 
 		 145 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  45.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  29.73 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>