29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2729 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  350  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  50.46 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  50.38 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  41.54 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  41.06 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  35.84 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  38.76 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  39.53 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  51.43 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  39.86 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  39.66 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  38.35 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  36.43 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  39.47 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  44.07 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  41.12 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  37.31 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  38.39 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  40.18 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  31.62 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3883  hypothetical protein  32.14 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.086934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  36.75 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  41.28 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  41.96 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2768  hypothetical protein  43.75 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  30.7 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>