28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_47530 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_47530  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  284  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0219  hypothetical protein  53.69 
 
 
160 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0264  hypothetical protein  52.35 
 
 
160 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0216  hypothetical protein  54.36 
 
 
159 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.851915  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5479  hypothetical protein  50.34 
 
 
153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0195  hypothetical protein  53.69 
 
 
159 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41313  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0137  hypothetical protein  47.74 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0053  hypothetical protein  49.01 
 
 
158 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  53.79 
 
 
159 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5999  hypothetical protein  53.79 
 
 
159 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0288  hypothetical protein  48.3 
 
 
147 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3137  hypothetical protein  45.28 
 
 
171 aa  76.6  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.46555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4729  hypothetical protein  45 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1307  hypothetical protein  44.12 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1885  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2273  hypothetical protein  44.09 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131993  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4933  hypothetical protein  38.6 
 
 
186 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361826  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0909  hypothetical protein  38.18 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  35.38 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1092  hypothetical protein  35.83 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2729  hypothetical protein  43.27 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0746343  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4701  hypothetical protein  34.26 
 
 
171 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.182755  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  31.62 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  33.1 
 
 
198 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3302  hypothetical protein  34.74 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.970623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0715  hypothetical protein  31.43 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0472  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  32.05 
 
 
160 aa  42  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0902  hypothetical protein  36.45 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0135492  normal  0.076763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>